BLASTX nr result
ID: Zingiber25_contig00000856
seq
BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Zingiber25_contig00000856
(1023 letters)
Database: ./nr
37,332,560 sequences; 13,225,080,153 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
ref|XP_006424984.1| hypothetical protein CICLE_v10028436mg [Citr... 660 0.0
ref|XP_004249594.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu... 659 0.0
ref|XP_004249588.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu... 659 0.0
ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus commun... 659 0.0
gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis] 659 0.0
gb|EMJ06322.1| hypothetical protein PRUPE_ppa004884mg [Prunus pe... 659 0.0
gb|ACI03399.1| beta-tubulin [Prunus salicina var. cordata] 659 0.0
ref|XP_006287738.1| hypothetical protein CARUB_v10000948mg [Caps... 658 0.0
ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|... 658 0.0
ref|XP_002313404.1| hypothetical protein POPTR_0009s04500g [Popu... 657 0.0
gb|EXC19132.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis] 657 0.0
ref|NP_568437.1| tubulin beta-8 chain [Arabidopsis thaliana] gi|... 657 0.0
sp|P37392.1|TBB1_LUPAL RecName: Full=Tubulin beta-1 chain; AltNa... 657 0.0
sp|Q8H7U1.1|TBB2_ORYSJ RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltNa... 657 0.0
ref|XP_006490393.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Citrus... 657 0.0
gb|ESW15414.1| hypothetical protein PHAVU_007G070800g [Phaseolus... 657 0.0
ref|XP_006421924.1| hypothetical protein CICLE_v10004755mg [Citr... 657 0.0
ref|XP_006394642.1| hypothetical protein EUTSA_v10004208mg [Eutr... 657 0.0
ref|XP_006827680.1| hypothetical protein AMTR_s00009p00255970 [A... 657 0.0
gb|AGT02044.1| beta-tubulin [Dimocarpus longan] 657 0.0
>ref|XP_006424984.1| hypothetical protein CICLE_v10028436mg [Citrus clementina]
gi|568870498|ref|XP_006488439.1| PREDICTED: tubulin
beta-2 chain-like [Citrus sinensis]
gi|557526918|gb|ESR38224.1| hypothetical protein
CICLE_v10028436mg [Citrus clementina]
Length = 448
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Identities = 322/340 (94%), Positives = 325/340 (95%)
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>ref|XP_004249594.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum]
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Frame = -3
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DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM
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>ref|XP_004249588.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum]
Length = 448
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Sbjct: 364 ASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 403
>ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis]
gi|223540293|gb|EEF41864.1| tubulin beta chain, putative
[Ricinus communis]
Length = 545
Score = 659 bits (1700), Expect = 0.0
Identities = 321/340 (94%), Positives = 325/340 (95%)
Frame = -3
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ENCDCLQGFQVCH LISKIREEYPDRMM+TFSVFPSPKVSDTVVEPY
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Sbjct: 461 ASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 500
>gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis]
Length = 447
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ENCDCLQGFQVCH LISKIREEYPDRMM+TFSVFPSPKVSDTVVEPY
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>gb|EMJ06322.1| hypothetical protein PRUPE_ppa004884mg [Prunus persica]
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+STFIGNSTSIQEMF RVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM
Sbjct: 405 ASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 444
>gb|ACI03399.1| beta-tubulin [Prunus salicina var. cordata]
Length = 446
Score = 659 bits (1699), Expect = 0.0
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Frame = -3
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ENCDCLQGFQVCH LISKIREEYPDRMMMTFSVFPSPKVSDTVVEPY
Sbjct: 124 AENCDCLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMMTFSVFPSPKVSDTVVEPY 183
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Sbjct: 244 GQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAA 303
Query: 301 DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM 122
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Sbjct: 304 DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDDQMMNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM 363
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Sbjct: 364 ASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 403
>ref|XP_006287738.1| hypothetical protein CARUB_v10000948mg [Capsella rubella]
gi|482556444|gb|EOA20636.1| hypothetical protein
CARUB_v10000948mg [Capsella rubella]
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Frame = -3
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Sbjct: 124 AENCDCLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPY 183
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Sbjct: 184 NATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFP 243
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Sbjct: 244 GQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAA 303
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Sbjct: 304 DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM 363
Query: 121 SSTFIGNSTSIQEMFHRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 2
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Sbjct: 364 ASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 403
>ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|355481332|gb|AES62535.1|
Tubulin beta chain [Medicago truncatula]
Length = 449
Score = 658 bits (1698), Expect = 0.0
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Frame = -3
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VLMDLEPGTMDS+RSGPYGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELID+VLDVVRKE
Sbjct: 64 VLMDLEPGTMDSVRSGPYGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELIDSVLDVVRKE 123
Query: 841 VENCDCLQGFQVCHXXXXXXXXXXXXXLISKIREEYPDRMMMTFSVFPSPKVSDTVVEPY 662
ENCDCLQGFQVCH LISKIREEYPDRMM+TFSVFPSPKVSDTVVEPY
Sbjct: 124 AENCDCLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPY 183
Query: 661 NATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFP 482
NATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFP
Sbjct: 184 NATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFP 243
Query: 481 GQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAA 302
GQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAA
Sbjct: 244 GQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAA 303
Query: 301 DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM 122
DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM
Sbjct: 304 DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM 363
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>ref|XP_002313404.1| hypothetical protein POPTR_0009s04500g [Populus trichocarpa]
gi|222849812|gb|EEE87359.1| hypothetical protein
POPTR_0009s04500g [Populus trichocarpa]
Length = 451
Score = 657 bits (1696), Expect = 0.0
Identities = 320/340 (94%), Positives = 325/340 (95%)
Frame = -3
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>gb|EXC19132.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis]
Length = 447
Score = 657 bits (1695), Expect = 0.0
Identities = 319/340 (93%), Positives = 325/340 (95%)
Frame = -3
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>ref|NP_568437.1| tubulin beta-8 chain [Arabidopsis thaliana]
gi|334187880|ref|NP_001190373.1| tubulin beta-8 chain
[Arabidopsis thaliana] gi|27735261|sp|P29516.2|TBB8_ARATH
RecName: Full=Tubulin beta-8 chain; AltName:
Full=Beta-8-tubulin gi|10176853|dbj|BAB10059.1| beta
tubulin [Arabidopsis thaliana]
gi|332005840|gb|AED93223.1| tubulin beta-8 chain
[Arabidopsis thaliana] gi|332005841|gb|AED93224.1|
tubulin beta-8 chain [Arabidopsis thaliana]
Length = 449
Score = 657 bits (1695), Expect = 0.0
Identities = 319/340 (93%), Positives = 325/340 (95%)
Frame = -3
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Sbjct: 304 DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM 363
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Sbjct: 364 ASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 403
>sp|P37392.1|TBB1_LUPAL RecName: Full=Tubulin beta-1 chain; AltName: Full=Beta-1-tubulin
gi|402636|emb|CAA49736.1| Beta tubulin 1 [Lupinus albus]
Length = 447
Score = 657 bits (1695), Expect = 0.0
Identities = 319/340 (93%), Positives = 325/340 (95%)
Frame = -3
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ENCDCLQGFQVCH LISKIREEYPDRMM+TFSVFPSPKVSDTVVEPY
Sbjct: 124 AENCDCLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPY 183
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Sbjct: 304 DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM 363
Query: 121 SSTFIGNSTSIQEMFHRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 2
+STFIGNSTSIQEMF RVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM
Sbjct: 364 ASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 403
>sp|Q8H7U1.1|TBB2_ORYSJ RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltName: Full=Beta-2-tubulin
gi|24418032|gb|AAN60482.1| Putative beta tubulin [Oryza
sativa Japonica Group] gi|108705732|gb|ABF93527.1|
Tubulin beta-2 chain, putative, expressed [Oryza sativa
Japonica Group] gi|215769447|dbj|BAH01676.1| unnamed
protein product [Oryza sativa Japonica Group]
Length = 447
Score = 657 bits (1695), Expect = 0.0
Identities = 320/340 (94%), Positives = 324/340 (95%)
Frame = -3
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VLMDLEPGTMDS+RSGPYG IFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELIDAVLDVVRKE
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ENCDCLQGFQVCH LISKIREEYPDRMM+TFSVFPSPKVSDTVVEPY
Sbjct: 124 AENCDCLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPY 183
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NATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFP
Sbjct: 184 NATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFP 243
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Sbjct: 244 GQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAA 303
Query: 301 DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM 122
DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM
Sbjct: 304 DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM 363
Query: 121 SSTFIGNSTSIQEMFHRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 2
+STFIGNSTSIQEMF RVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM
Sbjct: 364 ASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 403
>ref|XP_006490393.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Citrus sinensis]
Length = 446
Score = 657 bits (1695), Expect = 0.0
Identities = 319/340 (93%), Positives = 325/340 (95%)
Frame = -3
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Sbjct: 124 AENCDCLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPY 183
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NATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFP
Sbjct: 184 NATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFP 243
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Sbjct: 244 GQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAA 303
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Sbjct: 304 DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM 363
Query: 121 SSTFIGNSTSIQEMFHRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 2
+STFIGNSTSIQEMF RVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM
Sbjct: 364 ASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 403
>gb|ESW15414.1| hypothetical protein PHAVU_007G070800g [Phaseolus vulgaris]
Length = 449
Score = 657 bits (1695), Expect = 0.0
Identities = 319/340 (93%), Positives = 325/340 (95%)
Frame = -3
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Sbjct: 244 GQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAA 303
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Sbjct: 304 DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM 363
Query: 121 SSTFIGNSTSIQEMFHRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 2
+STFIGNSTSIQEMF RVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM
Sbjct: 364 ASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 403
>ref|XP_006421924.1| hypothetical protein CICLE_v10004755mg [Citrus clementina]
gi|557523797|gb|ESR35164.1| hypothetical protein
CICLE_v10004755mg [Citrus clementina]
Length = 514
Score = 657 bits (1695), Expect = 0.0
Identities = 319/340 (93%), Positives = 325/340 (95%)
Frame = -3
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ENCDCLQGFQVCH LISKIREEYPDRMM+TFSVFPSPKVSDTVVEPY
Sbjct: 192 AENCDCLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPY 251
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NATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFP
Sbjct: 252 NATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFP 311
Query: 481 GQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAA 302
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Sbjct: 312 GQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAA 371
Query: 301 DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM 122
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Sbjct: 372 DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM 431
Query: 121 SSTFIGNSTSIQEMFHRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 2
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Sbjct: 432 ASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 471
>ref|XP_006394642.1| hypothetical protein EUTSA_v10004208mg [Eutrema salsugineum]
gi|557091281|gb|ESQ31928.1| hypothetical protein
EUTSA_v10004208mg [Eutrema salsugineum]
Length = 450
Score = 657 bits (1695), Expect = 0.0
Identities = 319/340 (93%), Positives = 325/340 (95%)
Frame = -3
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Sbjct: 64 VLMDLEPGTMDSVRSGPYGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELIDSVLDVVRKE 123
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ENCDCLQGFQVCH LISKIREEYPDRMM+TFSVFPSPKVSDTVVEPY
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NATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFP
Sbjct: 184 NATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFP 243
Query: 481 GQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAA 302
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Sbjct: 244 GQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAA 303
Query: 301 DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM 122
DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM
Sbjct: 304 DPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM 363
Query: 121 SSTFIGNSTSIQEMFHRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 2
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Sbjct: 364 ASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGM 403
>ref|XP_006827680.1| hypothetical protein AMTR_s00009p00255970 [Amborella trichopoda]
gi|548832300|gb|ERM95096.1| hypothetical protein
AMTR_s00009p00255970 [Amborella trichopoda]
Length = 446
Score = 657 bits (1695), Expect = 0.0
Identities = 319/340 (93%), Positives = 325/340 (95%)
Frame = -3
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Sbjct: 64 VLMDLEPGTMDSVRSGPYGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELIDSVLDVVRKE 123
Query: 841 VENCDCLQGFQVCHXXXXXXXXXXXXXLISKIREEYPDRMMMTFSVFPSPKVSDTVVEPY 662
ENCDCLQGFQVCH LISKIREEYPDRMM+TFSVFPSPKVSDTVVEPY
Sbjct: 124 AENCDCLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPY 183
Query: 661 NATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFP 482
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ENCDCLQGFQVCH LISKIREEYPDRMM+TFSVFPSPKVSDTVVEPY
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