BLASTX nr result
ID: Zingiber24_contig00008194
seq
BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Zingiber24_contig00008194
(684 letters)
Database: ./nr
37,332,560 sequences; 13,225,080,153 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
sp|Q8H7U1.1|TBB2_ORYSJ RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltNa... 465 e-129
ref|XP_006649228.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Oryza ... 465 e-129
ref|XP_006339000.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like [Solanu... 465 e-129
gb|EOY33858.1| Tubulin beta 8 [Theobroma cacao] 465 e-129
ref|XP_004249594.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu... 465 e-129
ref|XP_004249588.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu... 465 e-129
ref|XP_004172348.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumi... 465 e-129
ref|XP_004147894.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumi... 465 e-129
ref|XP_002468688.1| hypothetical protein SORBIDRAFT_01g050310 [S... 465 e-129
gb|EEE58163.1| hypothetical protein OsJ_09084 [Oryza sativa Japo... 465 e-129
gb|EEC74344.1| hypothetical protein OsI_09642 [Oryza sativa Indi... 465 e-129
gb|ABY86665.1| beta-tubulin 19 [Gossypium hirsutum] 465 e-129
emb|CAM58986.1| beta tubulin 8 [Hordeum vulgare subsp. vulgare] ... 465 e-129
ref|XP_004986075.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Setari... 465 e-129
ref|XP_006350813.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Solanu... 464 e-129
ref|XP_004241186.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu... 464 e-129
gb|EXC19132.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis] 464 e-128
gb|EXB89975.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis] 464 e-128
gb|EXB30492.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis] 464 e-128
ref|NP_568437.1| tubulin beta-8 chain [Arabidopsis thaliana] gi|... 464 e-128
>sp|Q8H7U1.1|TBB2_ORYSJ RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltName: Full=Beta-2-tubulin
gi|24418032|gb|AAN60482.1| Putative beta tubulin [Oryza
sativa Japonica Group] gi|108705732|gb|ABF93527.1|
Tubulin beta-2 chain, putative, expressed [Oryza sativa
Japonica Group] gi|215769447|dbj|BAH01676.1| unnamed
protein product [Oryza sativa Japonica Group]
Length = 447
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>ref|XP_006649228.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Oryza brachyantha]
Length = 447
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>ref|XP_006339000.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like [Solanum tuberosum]
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>ref|XP_004249588.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum]
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>ref|XP_004147894.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumis sativus]
Length = 446
Score = 465 bits (1196), Expect = e-129
Identities = 226/227 (99%), Positives = 227/227 (100%)
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>ref|XP_002468688.1| hypothetical protein SORBIDRAFT_01g050310 [Sorghum bicolor]
gi|241922542|gb|EER95686.1| hypothetical protein
SORBIDRAFT_01g050310 [Sorghum bicolor]
gi|414864264|tpg|DAA42821.1| TPA: beta tubulin1 isoform
1 [Zea mays] gi|414864265|tpg|DAA42822.1| TPA: beta
tubulin1 isoform 2 [Zea mays]
Length = 446
Score = 465 bits (1196), Expect = e-129
Identities = 226/227 (99%), Positives = 227/227 (100%)
Frame = +3
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Sbjct: 381 VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQD 427
>gb|EEE58163.1| hypothetical protein OsJ_09084 [Oryza sativa Japonica Group]
Length = 480
Score = 465 bits (1196), Expect = e-129
Identities = 226/227 (99%), Positives = 227/227 (100%)
Frame = +3
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Sbjct: 414 VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQD 460
>gb|EEC74344.1| hypothetical protein OsI_09642 [Oryza sativa Indica Group]
Length = 441
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Sbjct: 375 VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQD 421
>gb|ABY86665.1| beta-tubulin 19 [Gossypium hirsutum]
Length = 444
Score = 465 bits (1196), Expect = e-129
Identities = 226/227 (99%), Positives = 227/227 (100%)
Frame = +3
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VLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPF
Sbjct: 201 VLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPF 260
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PRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGK
Sbjct: 261 PRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGK 320
Query: 363 MSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRR 542
MSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRR
Sbjct: 321 MSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRR 380
Query: 543 VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEYQQYQD 683
VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLV+EYQQYQD
Sbjct: 381 VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQD 427
>emb|CAM58986.1| beta tubulin 8 [Hordeum vulgare subsp. vulgare]
gi|326524376|dbj|BAK00571.1| predicted protein [Hordeum
vulgare subsp. vulgare] gi|473938525|gb|EMS50212.1|
Tubulin beta-2 chain [Triticum urartu]
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Score = 465 bits (1196), Expect = e-129
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>ref|XP_004241186.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum]
Length = 446
Score = 464 bits (1195), Expect = e-129
Identities = 225/227 (99%), Positives = 227/227 (100%)
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>gb|EXC19132.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis]
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>gb|EXB89975.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis]
Length = 447
Score = 464 bits (1194), Expect = e-128
Identities = 225/227 (99%), Positives = 227/227 (100%)
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VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLV+EYQQYQD
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>gb|EXB30492.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis]
Length = 448
Score = 464 bits (1194), Expect = e-128
Identities = 225/227 (99%), Positives = 227/227 (100%)
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VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEYQQYQD
Sbjct: 381 VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEYQQYQD 427
>ref|NP_568437.1| tubulin beta-8 chain [Arabidopsis thaliana]
gi|334187880|ref|NP_001190373.1| tubulin beta-8 chain
[Arabidopsis thaliana]
gi|27735261|sp|P29516.2|TBB8_ARATH RecName: Full=Tubulin
beta-8 chain; AltName: Full=Beta-8-tubulin
gi|10176853|dbj|BAB10059.1| beta tubulin [Arabidopsis
thaliana] gi|332005840|gb|AED93223.1| tubulin beta-8
chain [Arabidopsis thaliana] gi|332005841|gb|AED93224.1|
tubulin beta-8 chain [Arabidopsis thaliana]
Length = 449
Score = 464 bits (1194), Expect = e-128
Identities = 225/227 (99%), Positives = 227/227 (100%)
Frame = +3
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VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLV+EYQQYQD
Sbjct: 381 VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQD 427