BLASTX nr result
ID: Rehmannia30_contig00000341
seq
BLASTX 2.2.26 [Sep-21-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Rehmannia30_contig00000341
(757 letters)
Database: All non-redundant GenBank CDS
translations+PDB+SwissProt+PIR+PRF excluding environmental samples
from WGS projects
149,584,005 sequences; 54,822,741,787 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gb|PNY16667.1| tubulin beta-1 chain-like protein, partial [Trifo... 513 0.0
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ref|XP_010495405.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like, partia... 513 0.0
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ref|XP_021300515.1| tubulin beta-1 chain [Herrania umbratica] 512 0.0
gb|ANJ77662.1| beta-tubulin, partial [Solanum rostratum] 511 0.0
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gb|ANJ77661.1| beta-tubulin, partial [Solanum rostratum] 509 0.0
gb|PKI32270.1| hypothetical protein CRG98_047356 [Punica granatum] 511 0.0
ref|XP_012836290.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain [Erythranthe... 513 0.0
dbj|BAN19963.1| tubulin, partial [Echinochloa phyllopogon] >gi|6... 506 0.0
gb|PIA49473.1| hypothetical protein AQUCO_01300346v1 [Aquilegia ... 513 0.0
gb|KZV16088.1| hypothetical protein F511_24881 [Dorcoceras hygro... 513 0.0
ref|XP_022862927.1| tubulin beta-8 chain-like [Olea europaea var... 513 0.0
ref|XP_011072460.1| tubulin beta-8 chain-like [Sesamum indicum] 513 0.0
ref|XP_004234396.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Solanum lyc... 513 0.0
ref|XP_018852463.1| PREDICTED: tubulin beta-9 chain [Juglans regia] 513 0.0
gb|PIA54490.1| hypothetical protein AQUCO_00900796v1 [Aquilegia ... 513 0.0
>gb|PNY16667.1| tubulin beta-1 chain-like protein, partial [Trifolium pratense]
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>gb|KJB25806.1| hypothetical protein B456_004G210600 [Gossypium raimondii]
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>gb|OMO97425.1| Tubulin [Corchorus olitorius]
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GEGMDEMEFTE
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>gb|ACF86588.1| unknown [Zea mays]
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GEGMDEMEFTE
Sbjct: 254 GEGMDEMEFTE 264
>gb|ANJ77661.1| beta-tubulin, partial [Solanum rostratum]
Length = 313
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GEGMDEMEFTE
Sbjct: 296 GEGMDEMEFTE 306
>gb|PKI32270.1| hypothetical protein CRG98_047356 [Punica granatum]
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Sbjct: 148 PSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQ 207
Query: 395 QYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSS 216
QYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASA+FRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSS
Sbjct: 208 QYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSS 267
Query: 215 YFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT 36
YFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT
Sbjct: 268 YFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT 327
Query: 35 GEGMDEMEFTE 3
GEGMDEMEFTE
Sbjct: 328 GEGMDEMEFTE 338
>ref|XP_012836290.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain [Erythranthe guttata]
gb|EYU38358.1| hypothetical protein MIMGU_mgv1a007077mg [Erythranthe guttata]
Length = 420
Score = 513 bits (1320), Expect = 0.0
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Frame = -3
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GEGMDEMEFTE
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