BLASTX nr result
ID: Rehmannia29_contig00002562
seq
BLASTX 2.2.26 [Sep-21-2011] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= Rehmannia29_contig00002562 (909 letters) Database: All non-redundant GenBank CDS translations+PDB+SwissProt+PIR+PRF excluding environmental samples from WGS projects 149,584,005 sequences; 54,822,741,787 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value dbj|BAN42598.1| putative beta-tubulin, partial [Pyrus pyrifolia ... 410 e-142 gb|PNY16667.1| tubulin beta-1 chain-like protein, partial [Trifo... 412 e-142 gb|ONK57056.1| uncharacterized protein A4U43_C10F16160 [Asparagu... 409 e-142 ref|XP_012092857.2| tubulin beta-1 chain [Jatropha curcas] 411 e-142 ref|XP_010550770.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like [Tarena... 411 e-142 ref|XP_008344782.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Malus ... 408 e-142 ref|XP_010495405.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like, partia... 412 e-141 gb|KJB25806.1| hypothetical protein B456_004G210600 [Gossypium r... 410 e-141 ref|XP_021300515.1| tubulin beta-1 chain [Herrania umbratica] 411 e-141 gb|ONK76859.1| uncharacterized protein A4U43_C02F580 [Asparagus ... 411 e-141 gb|PKI32270.1| hypothetical protein CRG98_047356 [Punica granatum] 411 e-141 gb|OMO97425.1| Tubulin [Corchorus olitorius] 411 e-141 gb|ACF86588.1| unknown [Zea mays] 408 e-141 ref|XP_015873189.1| PREDICTED: tubulin beta-4 chain-like, partia... 405 e-140 gb|KZV16088.1| hypothetical protein F511_24881 [Dorcoceras hygro... 413 e-140 dbj|BAS77162.1| Os02g0167300, partial [Oryza sativa Japonica Group] 408 e-140 ref|XP_022862927.1| tubulin beta-8 chain-like [Olea europaea var... 413 e-140 ref|XP_011072460.1| tubulin beta-8 chain-like [Sesamum indicum] 413 e-140 ref|XP_018852463.1| PREDICTED: tubulin beta-9 chain [Juglans regia] 413 e-140 gb|ONK62130.1| uncharacterized protein A4U43_C07F660 [Asparagus ... 410 e-140 >dbj|BAN42598.1| putative beta-tubulin, partial [Pyrus pyrifolia var. culta] Length = 232 Score = 410 bits (1053), Expect = e-142 Identities = 198/202 (98%), Positives = 202/202 (100%) Frame = -1 Query: 909 GDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYR 730 GDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYR Sbjct: 9 GDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYR 68 Query: 729 ALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFV 550 ALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASA+FRGKMSTKEVD+QM+NVQNKNSSYFV Sbjct: 69 ALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDDQMMNVQNKNSSYFV 128 Query: 549 EWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEG 370 EWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEG Sbjct: 129 EWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEG 188 Query: 369 MDEMEFTEAESNMNDLVAEYQQ 304 MDEMEFTEAESNMNDLV+EYQQ Sbjct: 189 MDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQ 210 >gb|PNY16667.1| tubulin beta-1 chain-like protein, partial [Trifolium pratense] Length = 318 Score = 412 bits (1059), Expect = e-142 Identities = 200/202 (99%), Positives = 202/202 (100%) Frame = -1 Query: 909 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