BLASTX nr result
ID: Rehmannia25_contig00000748
seq
BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= Rehmannia25_contig00000748 (742 letters) Database: ./nr 37,332,560 sequences; 13,225,080,153 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value ref|XP_006353299.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like isoform... 502 e-140 ref|XP_006287738.1| hypothetical protein CARUB_v10000948mg [Caps... 502 e-140 ref|XP_004234396.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu... 502 e-140 ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|... 502 e-140 ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachy... 501 e-140 ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus commun... 501 e-140 gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis] 501 e-140 gb|EXC19132.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis] 501 e-139 gb|EXB89975.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis] 501 e-139 ref|NP_568437.1| tubulin beta-8 chain [Arabidopsis thaliana] gi|... 501 e-139 dbj|BAA82637.1| 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[Capsella rubella] gi|482556444|gb|EOA20636.1| hypothetical protein CARUB_v10000948mg [Capsella rubella] Length = 449 Score = 502 bits (1293), Expect = e-140 Identities = 245/246 (99%), Positives = 246/246 (100%) Frame = -3 Query: 740 LTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGD 561 LTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGD Sbjct: 165 LTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGD 224 Query: 560 LNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRAL 381 LNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRAL Sbjct: 225 LNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRAL 284 Query: 380 TVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEW 201 TVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASA+FRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEW Sbjct: 285 TVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEW 344 Query: 200 IPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMD 21 IPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMD 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