BLASTX nr result

ID: Rehmannia25_contig00000748 seq

BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Rehmannia25_contig00000748
         (742 letters)

Database: ./nr 
           37,332,560 sequences; 13,225,080,153 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

ref|XP_006353299.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like isoform...   502   e-140
ref|XP_006287738.1| hypothetical protein CARUB_v10000948mg [Caps...   502   e-140
ref|XP_004234396.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu...   502   e-140
ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|...   502   e-140
ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachy...   501   e-140
ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus commun...   501   e-140
gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis]                      501   e-140
gb|EXC19132.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis]                 501   e-139
gb|EXB89975.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis]                 501   e-139
ref|NP_568437.1| tubulin beta-8 chain [Arabidopsis thaliana] gi|...   501   e-139
dbj|BAA82637.1| Beta-tubulin [Zinnia elegans]                         501   e-139
sp|P37392.1|TBB1_LUPAL RecName: Full=Tubulin beta-1 chain; AltNa...   501   e-139
ref|XP_006490393.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Citrus...   501   e-139
gb|ESW15414.1| hypothetical protein PHAVU_007G070800g [Phaseolus...   501   e-139
ref|XP_006421924.1| hypothetical protein CICLE_v10004755mg [Citr...   501   e-139
ref|XP_006394642.1| hypothetical protein EUTSA_v10004208mg [Eutr...   501   e-139
ref|XP_006848044.1| hypothetical protein AMTR_s00029p00190040 [A...   501   e-139
ref|XP_006827680.1| hypothetical protein AMTR_s00009p00255970 [A...   501   e-139
gb|AGT02044.1| beta-tubulin [Dimocarpus longan]                       501   e-139
ref|XP_004496560.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cicer ...   501   e-139

>ref|XP_006353299.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like isoform X1 [Solanum tuberosum]
           gi|565373479|ref|XP_006353300.1| PREDICTED: tubulin
           beta-1 chain-like isoform X2 [Solanum tuberosum]
          Length = 447

 Score =  502 bits (1293), Expect = e-140
 Identities = 245/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

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>ref|XP_006287738.1| hypothetical protein CARUB_v10000948mg [Capsella rubella]
           gi|482556444|gb|EOA20636.1| hypothetical protein
           CARUB_v10000948mg [Capsella rubella]
          Length = 449

 Score =  502 bits (1293), Expect = e-140
 Identities = 245/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

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>ref|XP_004234396.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum]
          Length = 445

 Score =  502 bits (1293), Expect = e-140
 Identities = 245/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

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>ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula]
           gi|355481332|gb|AES62535.1| Tubulin beta chain [Medicago
           truncatula]
          Length = 449

 Score =  502 bits (1293), Expect = e-140
 Identities = 245/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

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Sbjct: 405 EMEFTE 410


>ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachypodium distachyon]
          Length = 448

 Score =  501 bits (1291), Expect = e-140
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>ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis]
           gi|223540293|gb|EEF41864.1| tubulin beta chain, putative
           [Ricinus communis]
          Length = 545

 Score =  501 bits (1291), Expect = e-140
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Query: 20  EMEFTE 3
           EMEFTE
Sbjct: 502 EMEFTE 507


>gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis]
          Length = 447

 Score =  501 bits (1291), Expect = e-140
 Identities = 244/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

Query: 740 LTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGD 561
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Query: 20  EMEFTE 3
           EMEFTE
Sbjct: 405 EMEFTE 410


>gb|EXC19132.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis]
          Length = 447

 Score =  501 bits (1290), Expect = e-139
 Identities = 244/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

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Query: 200 IPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMD 21
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Query: 20  EMEFTE 3
           EMEFTE
Sbjct: 405 EMEFTE 410


>gb|EXB89975.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis]
          Length = 447

 Score =  501 bits (1290), Expect = e-139
 Identities = 244/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

Query: 740 LTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGD 561
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Query: 560 LNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRAL 381
           LNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRAL
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Query: 380 TVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEW 201
           TVPELTQQMWD+KNMMCAADPRHGRYLTASA+FRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEW
Sbjct: 285 TVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEW 344

Query: 200 IPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMD 21
           IPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMD
Sbjct: 345 IPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMD 404

Query: 20  EMEFTE 3
           EMEFTE
Sbjct: 405 EMEFTE 410


>ref|NP_568437.1| tubulin beta-8 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|334187880|ref|NP_001190373.1| tubulin beta-8 chain
           [Arabidopsis thaliana]
           gi|27735261|sp|P29516.2|TBB8_ARATH RecName: Full=Tubulin
           beta-8 chain; AltName: Full=Beta-8-tubulin
           gi|10176853|dbj|BAB10059.1| beta tubulin [Arabidopsis
           thaliana] gi|332005840|gb|AED93223.1| tubulin beta-8
           chain [Arabidopsis thaliana] gi|332005841|gb|AED93224.1|
           tubulin beta-8 chain [Arabidopsis thaliana]
          Length = 449

 Score =  501 bits (1290), Expect = e-139
 Identities = 244/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

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>dbj|BAA82637.1| Beta-tubulin [Zinnia elegans]
          Length = 448

 Score =  501 bits (1290), Expect = e-139
 Identities = 244/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
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>sp|P37392.1|TBB1_LUPAL RecName: Full=Tubulin beta-1 chain; AltName: Full=Beta-1-tubulin
           gi|402636|emb|CAA49736.1| Beta tubulin 1 [Lupinus albus]
          Length = 447

 Score =  501 bits (1290), Expect = e-139
 Identities = 244/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

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>ref|XP_006490393.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Citrus sinensis]
          Length = 446

 Score =  501 bits (1290), Expect = e-139
 Identities = 244/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

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>gb|ESW15414.1| hypothetical protein PHAVU_007G070800g [Phaseolus vulgaris]
          Length = 449

 Score =  501 bits (1290), Expect = e-139
 Identities = 244/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

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>ref|XP_006421924.1| hypothetical protein CICLE_v10004755mg [Citrus clementina]
           gi|557523797|gb|ESR35164.1| hypothetical protein
           CICLE_v10004755mg [Citrus clementina]
          Length = 514

 Score =  501 bits (1290), Expect = e-139
 Identities = 244/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

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           EMEFTE
Sbjct: 473 EMEFTE 478


>ref|XP_006394642.1| hypothetical protein EUTSA_v10004208mg [Eutrema salsugineum]
           gi|557091281|gb|ESQ31928.1| hypothetical protein
           EUTSA_v10004208mg [Eutrema salsugineum]
          Length = 450

 Score =  501 bits (1290), Expect = e-139
 Identities = 244/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

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           EMEFTE
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>ref|XP_006848044.1| hypothetical protein AMTR_s00029p00190040 [Amborella trichopoda]
           gi|548851349|gb|ERN09625.1| hypothetical protein
           AMTR_s00029p00190040 [Amborella trichopoda]
          Length = 446

 Score =  501 bits (1290), Expect = e-139
 Identities = 244/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

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           EMEFTE
Sbjct: 405 EMEFTE 410


>ref|XP_006827680.1| hypothetical protein AMTR_s00009p00255970 [Amborella trichopoda]
           gi|548832300|gb|ERM95096.1| hypothetical protein
           AMTR_s00009p00255970 [Amborella trichopoda]
          Length = 446

 Score =  501 bits (1290), Expect = e-139
 Identities = 244/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

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           EMEFTE
Sbjct: 405 EMEFTE 410


>gb|AGT02044.1| beta-tubulin [Dimocarpus longan]
          Length = 446

 Score =  501 bits (1290), Expect = e-139
 Identities = 244/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

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           TVPELTQQMWD+KNMMCAADPRHGRYLTASA+FRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEW
Sbjct: 285 TVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEW 344

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           EMEFTE
Sbjct: 405 EMEFTE 410


>ref|XP_004496560.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cicer arietinum]
          Length = 448

 Score =  501 bits (1290), Expect = e-139
 Identities = 244/246 (99%), Positives = 246/246 (100%)
 Frame = -3

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Sbjct: 225 LNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRAL 284

Query: 380 TVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEW 201
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Sbjct: 285 TVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEW 344

Query: 200 IPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMD 21
           IPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMD
Sbjct: 345 IPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMD 404

Query: 20  EMEFTE 3
           EMEFTE
Sbjct: 405 EMEFTE 410


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