BLASTX nr result

ID: Papaver25_contig00001250 seq

BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Papaver25_contig00001250
         (773 letters)

Database: ./nr 
           38,876,450 sequences; 13,856,398,315 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

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ref|XP_004294235.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Fragar...   484   e-134
ref|XP_007205123.1| hypothetical protein PRUPE_ppa004884mg [Prun...   484   e-134
ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachy...   484   e-134
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gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis]                      484   e-134
ref|XP_006287738.1| hypothetical protein CARUB_v10000948mg [Caps...   484   e-134
ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|...   484   e-134
ref|NP_568959.1| tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thalia...   483   e-134
sp|Q8H7U1.1|TBB2_ORYSJ RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltNa...   483   e-134
ref|XP_006649228.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Oryza ...   483   e-134
ref|XP_006339000.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like [Solanu...   483   e-134
gb|AGN95064.1| putative tubulin beta-2-like protein [Physaria fe...   483   e-134
ref|XP_007016239.1| Tubulin beta 8 [Theobroma cacao] gi|50878660...   483   e-134
ref|XP_006291122.1| hypothetical protein CARUB_v10017235mg [Caps...   483   e-134
ref|XP_004249594.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu...   483   e-134
ref|XP_004249588.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu...   483   e-134
ref|XP_003520939.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Glycin...   483   e-134
ref|XP_003516925.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Glycin...   483   e-134

>ref|XP_006424984.1| hypothetical protein CICLE_v10028436mg [Citrus clementina]
           gi|568870498|ref|XP_006488439.1| PREDICTED: tubulin
           beta-2 chain-like [Citrus sinensis]
           gi|557526918|gb|ESR38224.1| hypothetical protein
           CICLE_v10028436mg [Citrus clementina]
          Length = 448

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>ref|XP_004294235.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Fragaria vesca subsp. vesca]
           gi|558850630|gb|AHA91828.1| beta-tubulin-2 [Rosa hybrid
           cultivar]
          Length = 446

 Score =  484 bits (1247), Expect = e-134
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 Frame = -3

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>ref|XP_007205123.1| hypothetical protein PRUPE_ppa004884mg [Prunus persica]
           gi|462400765|gb|EMJ06322.1| hypothetical protein
           PRUPE_ppa004884mg [Prunus persica]
          Length = 487

 Score =  484 bits (1247), Expect = e-134
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>ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachypodium distachyon]
          Length = 448

 Score =  484 bits (1247), Expect = e-134
 Identities = 235/237 (99%), Positives = 237/237 (100%)
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>ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis]
            gi|223540293|gb|EEF41864.1| tubulin beta chain, putative
            [Ricinus communis]
          Length = 545

 Score =  484 bits (1247), Expect = e-134
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>gb|ACI03399.1| beta-tubulin [Prunus salicina var. cordata]
          Length = 446

 Score =  484 bits (1247), Expect = e-134
 Identities = 235/237 (99%), Positives = 237/237 (100%)
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>gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis]
          Length = 447

 Score =  484 bits (1247), Expect = e-134
 Identities = 235/237 (99%), Positives = 237/237 (100%)
 Frame = -3

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Query: 411 AMFRGKMSTKEVDEQMMNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 232
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>ref|XP_006287738.1| hypothetical protein CARUB_v10000948mg [Capsella rubella]
           gi|482556444|gb|EOA20636.1| hypothetical protein
           CARUB_v10000948mg [Capsella rubella]
          Length = 449

 Score =  484 bits (1246), Expect = e-134
 Identities = 235/237 (99%), Positives = 237/237 (100%)
 Frame = -3

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Query: 411 AMFRGKMSTKEVDEQMMNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 232
           AMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI
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>ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula]
           gi|355481332|gb|AES62535.1| Tubulin beta chain [Medicago
           truncatula]
          Length = 449

 Score =  484 bits (1246), Expect = e-134
 Identities = 235/237 (99%), Positives = 237/237 (100%)
 Frame = -3

Query: 771 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 592
           NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA
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Query: 591 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 412
           VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRAL+VPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS
Sbjct: 255 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 314

Query: 411 AMFRGKMSTKEVDEQMMNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 232
           AMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI
Sbjct: 315 AMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 374

Query: 231 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAD 61
           QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAD
Sbjct: 375 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAD 431


>ref|NP_568959.1| tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|18424622|ref|NP_568960.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
           [Arabidopsis thaliana]
           gi|408407919|sp|Q56YW9.2|TBB2_ARATH RecName:
           Full=Tubulin beta-2 chain
           gi|408407920|sp|Q9ASR0.2|TBB3_ARATH RecName:
           Full=Tubulin beta-3 chain gi|166898|gb|AAA32881.1|
           beta-2 tubulin [Arabidopsis thaliana]
           gi|166900|gb|AAA32882.1| beta-3 tubulin [Arabidopsis
           thaliana] gi|8809665|dbj|BAA97216.1| tubulin
           beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|10177447|dbj|BAB10838.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
           [Arabidopsis thaliana] gi|15912267|gb|AAL08267.1|
           AT5g62690/MRG21_11 [Arabidopsis thaliana]
           gi|16974570|gb|AAL31181.1| AT5g62700/MRG21_12
           [Arabidopsis thaliana] gi|17065076|gb|AAL32692.1|
           tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|17065332|gb|AAL32820.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
           [Arabidopsis thaliana] gi|21593444|gb|AAM65411.1|
           tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|22136214|gb|AAM91185.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
           [Arabidopsis thaliana] gi|26449951|dbj|BAC42096.1|
           putative tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis
           thaliana] gi|27311963|gb|AAO00947.1| tubulin
           beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|332010260|gb|AED97643.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
           [Arabidopsis thaliana] gi|332010261|gb|AED97644.1|
           tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
          Length = 450

 Score =  483 bits (1244), Expect = e-134
 Identities = 234/237 (98%), Positives = 237/237 (100%)
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>sp|Q8H7U1.1|TBB2_ORYSJ RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltName: Full=Beta-2-tubulin
           gi|24418032|gb|AAN60482.1| Putative beta tubulin [Oryza
           sativa Japonica Group] gi|108705732|gb|ABF93527.1|
           Tubulin beta-2 chain, putative, expressed [Oryza sativa
           Japonica Group] gi|215769447|dbj|BAH01676.1| unnamed
           protein product [Oryza sativa Japonica Group]
          Length = 447

 Score =  483 bits (1244), Expect = e-134
 Identities = 234/237 (98%), Positives = 237/237 (100%)
 Frame = -3

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>ref|XP_006649228.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Oryza brachyantha]
          Length = 447

 Score =  483 bits (1244), Expect = e-134
 Identities = 234/237 (98%), Positives = 237/237 (100%)
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>ref|XP_006339000.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like [Solanum tuberosum]
          Length = 447

 Score =  483 bits (1244), Expect = e-134
 Identities = 234/237 (98%), Positives = 237/237 (100%)
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>gb|AGN95064.1| putative tubulin beta-2-like protein [Physaria fendleri]
          Length = 450

 Score =  483 bits (1244), Expect = e-134
 Identities = 234/237 (98%), Positives = 237/237 (100%)
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>ref|XP_007016239.1| Tubulin beta 8 [Theobroma cacao] gi|508786602|gb|EOY33858.1|
           Tubulin beta 8 [Theobroma cacao]
          Length = 444

 Score =  483 bits (1244), Expect = e-134
 Identities = 234/237 (98%), Positives = 237/237 (100%)
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>ref|XP_006291122.1| hypothetical protein CARUB_v10017235mg [Capsella rubella]
           gi|565469890|ref|XP_006292748.1| hypothetical protein
           CARUB_v10018995mg [Capsella rubella]
           gi|482559829|gb|EOA24020.1| hypothetical protein
           CARUB_v10017235mg [Capsella rubella]
           gi|482561455|gb|EOA25646.1| hypothetical protein
           CARUB_v10018995mg [Capsella rubella]
          Length = 451

 Score =  483 bits (1244), Expect = e-134
 Identities = 234/237 (98%), Positives = 237/237 (100%)
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>ref|XP_004249594.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum]
          Length = 446

 Score =  483 bits (1244), Expect = e-134
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>ref|XP_004249588.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum]
          Length = 448

 Score =  483 bits (1244), Expect = e-134
 Identities = 234/237 (98%), Positives = 237/237 (100%)
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>ref|XP_003520939.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Glycine max]
          Length = 449

 Score =  483 bits (1244), Expect = e-134
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>ref|XP_003516925.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Glycine max]
          Length = 449

 Score =  483 bits (1244), Expect = e-134
 Identities = 235/237 (99%), Positives = 237/237 (100%)
 Frame = -3

Query: 771 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 592
           NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA
Sbjct: 195 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 254

Query: 591 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 412
           VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS
Sbjct: 255 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 314

Query: 411 AMFRGKMSTKEVDEQMMNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 232
           AMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIP+NVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI
Sbjct: 315 AMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPHNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 374

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