BLASTX nr result
ID: Papaver25_contig00001250
seq
BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Papaver25_contig00001250
(773 letters)
Database: ./nr
38,876,450 sequences; 13,856,398,315 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
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ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus commun... 484 e-134
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ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|... 484 e-134
ref|NP_568959.1| tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thalia... 483 e-134
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ref|XP_004249594.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu... 483 e-134
ref|XP_004249588.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu... 483 e-134
ref|XP_003520939.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Glycin... 483 e-134
ref|XP_003516925.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Glycin... 483 e-134
>ref|XP_006424984.1| hypothetical protein CICLE_v10028436mg [Citrus clementina]
gi|568870498|ref|XP_006488439.1| PREDICTED: tubulin
beta-2 chain-like [Citrus sinensis]
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CICLE_v10028436mg [Citrus clementina]
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>ref|XP_004294235.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Fragaria vesca subsp. vesca]
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cultivar]
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>ref|XP_007205123.1| hypothetical protein PRUPE_ppa004884mg [Prunus persica]
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PRUPE_ppa004884mg [Prunus persica]
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>ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachypodium distachyon]
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>ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis]
gi|223540293|gb|EEF41864.1| tubulin beta chain, putative
[Ricinus communis]
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>gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis]
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gi|482556444|gb|EOA20636.1| hypothetical protein
CARUB_v10000948mg [Capsella rubella]
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>ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula]
gi|355481332|gb|AES62535.1| Tubulin beta chain [Medicago
truncatula]
Length = 449
Score = 484 bits (1246), Expect = e-134
Identities = 235/237 (99%), Positives = 237/237 (100%)
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>ref|NP_568959.1| tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
gi|18424622|ref|NP_568960.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
[Arabidopsis thaliana]
gi|408407919|sp|Q56YW9.2|TBB2_ARATH RecName:
Full=Tubulin beta-2 chain
gi|408407920|sp|Q9ASR0.2|TBB3_ARATH RecName:
Full=Tubulin beta-3 chain gi|166898|gb|AAA32881.1|
beta-2 tubulin [Arabidopsis thaliana]
gi|166900|gb|AAA32882.1| beta-3 tubulin [Arabidopsis
thaliana] gi|8809665|dbj|BAA97216.1| tubulin
beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
gi|10177447|dbj|BAB10838.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
[Arabidopsis thaliana] gi|15912267|gb|AAL08267.1|
AT5g62690/MRG21_11 [Arabidopsis thaliana]
gi|16974570|gb|AAL31181.1| AT5g62700/MRG21_12
[Arabidopsis thaliana] gi|17065076|gb|AAL32692.1|
tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
gi|17065332|gb|AAL32820.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
[Arabidopsis thaliana] gi|21593444|gb|AAM65411.1|
tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
gi|22136214|gb|AAM91185.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
[Arabidopsis thaliana] gi|26449951|dbj|BAC42096.1|
putative tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis
thaliana] gi|27311963|gb|AAO00947.1| tubulin
beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
gi|332010260|gb|AED97643.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
[Arabidopsis thaliana] gi|332010261|gb|AED97644.1|
tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
Length = 450
Score = 483 bits (1244), Expect = e-134
Identities = 234/237 (98%), Positives = 237/237 (100%)
Frame = -3
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NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA
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Query: 411 AMFRGKMSTKEVDEQMMNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 232
AMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI
Sbjct: 315 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 374
Query: 231 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAD 61
QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAD
Sbjct: 375 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAD 431
>sp|Q8H7U1.1|TBB2_ORYSJ RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltName: Full=Beta-2-tubulin
gi|24418032|gb|AAN60482.1| Putative beta tubulin [Oryza
sativa Japonica Group] gi|108705732|gb|ABF93527.1|
Tubulin beta-2 chain, putative, expressed [Oryza sativa
Japonica Group] gi|215769447|dbj|BAH01676.1| unnamed
protein product [Oryza sativa Japonica Group]
Length = 447
Score = 483 bits (1244), Expect = e-134
Identities = 234/237 (98%), Positives = 237/237 (100%)
Frame = -3
Query: 771 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 592
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>ref|XP_007016239.1| Tubulin beta 8 [Theobroma cacao] gi|508786602|gb|EOY33858.1|
Tubulin beta 8 [Theobroma cacao]
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>ref|XP_006291122.1| hypothetical protein CARUB_v10017235mg [Capsella rubella]
gi|565469890|ref|XP_006292748.1| hypothetical protein
CARUB_v10018995mg [Capsella rubella]
gi|482559829|gb|EOA24020.1| hypothetical protein
CARUB_v10017235mg [Capsella rubella]
gi|482561455|gb|EOA25646.1| hypothetical protein
CARUB_v10018995mg [Capsella rubella]
Length = 451
Score = 483 bits (1244), Expect = e-134
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Length = 448
Score = 483 bits (1244), Expect = e-134
Identities = 234/237 (98%), Positives = 237/237 (100%)
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Length = 449
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