BLASTX nr result
ID: Panax24_contig00004328
seq
BLASTX 2.2.26 [Sep-21-2011] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= Panax24_contig00004328 (894 letters) Database: ./nr 115,041,592 sequences; 42,171,959,267 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value ONK57056.1 uncharacterized protein A4U43_C10F16160 [Asparagus of... 393 e-136 BAN42598.1 putative beta-tubulin, partial [Pyrus pyrifolia var. ... 392 e-136 XP_008344782.1 PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Malus domes... 392 e-136 ANJ77661.1 beta-tubulin, partial [Solanum rostratum] 394 e-135 XP_010550770.1 PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like [Tarenaya ha... 394 e-135 ONK76859.1 uncharacterized protein A4U43_C02F580 [Asparagus offi... 395 e-135 XP_010495405.1 PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like, partial [Ca... 395 e-135 KJB25806.1 hypothetical protein B456_004G210600 [Gossypium raimo... 392 e-135 ONK62130.1 uncharacterized protein A4U43_C07F660 [Asparagus offi... 394 e-135 ANJ77662.1 beta-tubulin, partial [Solanum rostratum] 392 e-134 XP_017218857.1 PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Daucus carota su... 397 e-134 OMO97425.1 Tubulin [Corchorus olitorius] 394 e-134 XP_015950101.1 PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Arachis duranensis] 395 e-134 ACF86588.1 unknown [Zea mays] 391 e-134 ONK74454.1 uncharacterized protein A4U43_C03F6410 [Asparagus off... 393 e-134 XP_015873189.1 PREDICTED: tubulin beta-4 chain-like, partial [Zi... 388 e-134 XP_011072483.1 PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like [Sesamum ind... 396 e-134 XP_017242205.1 PREDICTED: tubulin beta chain-like [Daucus carota... 396 e-134 KHN26219.1 Tubulin beta-2 chain [Glycine soja] 394 e-134 XP_003604816.1 tubulin beta-1 chain [Medicago truncatula] AES870... 395 e-134 >ONK57056.1 uncharacterized protein A4U43_C10F16160 [Asparagus officinalis] Length = 231 Score = 393 bits (1009), Expect = e-136 Identities = 190/196 (96%), Positives = 194/196 (98%) Frame = -1 Query: 747 VGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQKY 568 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beta-1 chain [Daucus carota subsp. sativus] XP_017222855.1 PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Daucus carota subsp. sativus] Length = 447 Score = 397 bits (1020), Expect = e-134 Identities = 193/195 (98%), Positives = 194/195 (99%) Frame = -1 Query: 744 GDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQKYR 565 GDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQ+YR Sbjct: 223 GDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYR 282 Query: 564 ASSVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFV 385 A SVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFV Sbjct: 283 ALSVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFV 342 Query: 384 EWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEG 205 EWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEG Sbjct: 343 EWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEG 402 Query: 204 MDEMEFTEAESNMND 160 MDEMEFTEAESNMND Sbjct: 403 MDEMEFTEAESNMND 417 >OMO97425.1 Tubulin [Corchorus olitorius] 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