BLASTX nr result
ID: Ophiopogon23_contig00012899
seq
BLASTX 2.2.26 [Sep-21-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Ophiopogon23_contig00012899
(489 letters)
Database: All non-redundant GenBank CDS
translations+PDB+SwissProt+PIR+PRF excluding environmental samples
from WGS projects
149,584,005 sequences; 54,822,741,787 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
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ref|XP_012092857.2| tubulin beta-1 chain [Jatropha curcas] 337 e-115
ref|XP_010550770.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like [Tarena... 337 e-115
emb|CAN76383.1| hypothetical protein VITISV_015843 [Vitis vinifera] 333 e-115
ref|XP_008344782.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Malus ... 333 e-115
dbj|BAN42598.1| putative beta-tubulin, partial [Pyrus pyrifolia ... 333 e-115
ref|XP_021300515.1| tubulin beta-1 chain [Herrania umbratica] 337 e-114
gb|ANJ77662.1| beta-tubulin, partial [Solanum rostratum] 336 e-114
gb|PNY16667.1| tubulin beta-1 chain-like protein, partial [Trifo... 336 e-114
gb|ONK57056.1| uncharacterized protein A4U43_C10F16160 [Asparagu... 332 e-114
gb|ONK76859.1| uncharacterized protein A4U43_C02F580 [Asparagus ... 337 e-114
gb|ONM37144.1| beta tubulin6b [Zea mays] 331 e-114
gb|AFP44111.1| tubulin-beta, partial [Lycoris longituba] 335 e-114
gb|ACF86588.1| unknown [Zea mays] 334 e-114
gb|ANJ77661.1| beta-tubulin, partial [Solanum rostratum] 335 e-114
dbj|BAN42599.1| putative beta-tubulin, partial [Pyrus pyrifolia ... 332 e-114
>ref|XP_022145759.1| tubulin beta-8 chain-like [Momordica charantia]
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>gb|PNY16667.1| tubulin beta-1 chain-like protein, partial [Trifolium pratense]
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>gb|ONK76859.1| uncharacterized protein A4U43_C02F580 [Asparagus officinalis]
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Sbjct: 285 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMND 327
>gb|ONM37144.1| beta tubulin6b [Zea mays]
Length = 214
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Sbjct: 23 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTAS 82
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Sbjct: 83 AMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFIGNSTSI 142
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QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMND
Sbjct: 143 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMND 185
>gb|AFP44111.1| tubulin-beta, partial [Lycoris longituba]
Length = 310
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VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQY ALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTAS
Sbjct: 145 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYSALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTAS 204
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>gb|ACF86588.1| unknown [Zea mays]
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Score = 334 bits (857), Expect = e-114
Identities = 161/163 (98%), Positives = 162/163 (99%)
Frame = -1
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Sbjct: 229 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMND 271
>gb|ANJ77661.1| beta-tubulin, partial [Solanum rostratum]
Length = 313
Score = 335 bits (858), Expect = e-114
Identities = 161/163 (98%), Positives = 163/163 (100%)
Frame = -1
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>dbj|BAN42599.1| putative beta-tubulin, partial [Pyrus pyrifolia var. culta]
Length = 233
Score = 332 bits (850), Expect = e-114
Identities = 161/163 (98%), Positives = 161/163 (98%)
Frame = -1
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VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQY ALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTAS
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QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMD MEFTEAESNMND
Sbjct: 161 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDVMEFTEAESNMND 203