BLASTX nr result
ID: Glycyrrhiza34_contig00005900
seq
BLASTX 2.2.26 [Sep-21-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Glycyrrhiza34_contig00005900
(1274 letters)
Database: ./nr
115,041,592 sequences; 42,171,959,267 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
XP_010495405.1 PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like, partial [Ca... 583 0.0
OMO97425.1 Tubulin [Corchorus olitorius] 583 0.0
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XP_010273068.1 PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Nelumbo nuc... 585 0.0
XP_010255421.1 PREDICTED: tubulin beta-2 chain [Nelumbo nucifera... 585 0.0
AIA09927.1 beta-tubulin [Quercus suber] 585 0.0
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XP_006827680.1 PREDICTED: tubulin beta-2 chain [Amborella tricho... 585 0.0
AGT02044.1 beta-tubulin [Dimocarpus longan] 585 0.0
AGE44289.1 beta-tubulin [Dimocarpus longan] 585 0.0
OMO97855.1 Tubulin [Corchorus olitorius] 585 0.0
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XP_019246153.1 PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Nicotiana attenu... 585 0.0
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>XP_010495405.1 PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like, partial [Camelina sativa]
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>OMO97425.1 Tubulin [Corchorus olitorius]
Length = 374
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>XP_015950101.1 PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Arachis duranensis]
Length = 395
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>OMO95932.1 Tubulin [Corchorus capsularis]
Length = 446
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>XP_018828726.1 PREDICTED: tubulin beta-5 chain-like [Juglans regia]
Length = 446
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>XP_011076163.1 PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Sesamum indicum]
Length = 446
Score = 585 bits (1507), Expect = 0.0
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>XP_010273068.1 PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Nelumbo nucifera]
Length = 446
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TA
Sbjct: 429 TA 430
>XP_010255421.1 PREDICTED: tubulin beta-2 chain [Nelumbo nucifera] XP_010255422.1
PREDICTED: tubulin beta-2 chain [Nelumbo nucifera]
Length = 446
Score = 585 bits (1507), Expect = 0.0
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TA
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>AIA09927.1 beta-tubulin [Quercus suber]
Length = 446
Score = 585 bits (1507), Expect = 0.0
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Sbjct: 369 GNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDA 428
Query: 374 TA 369
TA
Sbjct: 429 TA 430
>XP_006490393.1 PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Citrus sinensis] KDO59996.1
hypothetical protein CISIN_1g013291mg [Citrus sinensis]
Length = 446
Score = 585 bits (1507), Expect = 0.0
Identities = 289/302 (95%), Positives = 289/302 (95%)
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CLQGFQVCH LISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLS
Sbjct: 129 CLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLS 188
Query: 1094 VHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNS 915
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Sbjct: 249 DLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHG 308
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RYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFI
Sbjct: 309 RYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFI 368
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GNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDA
Sbjct: 369 GNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDA 428
Query: 374 TA 369
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Sbjct: 429 TA 430
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hypothetical protein AMTR_s00029p00190040 [Amborella
trichopoda]
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>XP_006827680.1 PREDICTED: tubulin beta-2 chain [Amborella trichopoda] ERM95096.1
hypothetical protein AMTR_s00009p00255970 [Amborella
trichopoda]
Length = 446
Score = 585 bits (1507), Expect = 0.0
Identities = 289/302 (95%), Positives = 289/302 (95%)
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Sbjct: 429 TA 430
>AGE44289.1 beta-tubulin [Dimocarpus longan]
Length = 446
Score = 585 bits (1507), Expect = 0.0
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Sbjct: 429 TA 430
>OMO97855.1 Tubulin [Corchorus olitorius]
Length = 447
Score = 585 bits (1507), Expect = 0.0
Identities = 289/302 (95%), Positives = 289/302 (95%)
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Sbjct: 429 TA 430
>GAV88311.1 Tubulin domain-containing protein/Tubulin_C domain-containing protein
[Cephalotus follicularis]
Length = 447
Score = 585 bits (1507), Expect = 0.0
Identities = 289/302 (95%), Positives = 289/302 (95%)
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Sbjct: 429 TA 430
>XP_019200382.1 PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Ipomoea nil]
Length = 447
Score = 585 bits (1507), Expect = 0.0
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Sbjct: 309 RYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFI 368
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Sbjct: 369 GNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDA 428
Query: 374 TA 369
TA
Sbjct: 429 TA 430
>XP_019427284.1 PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Lupinus angustifolius] OIV91435.1
hypothetical protein TanjilG_02053 [Lupinus
angustifolius]
Length = 447
Score = 585 bits (1507), Expect = 0.0
Identities = 289/302 (95%), Positives = 289/302 (95%)
Frame = -1
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CLQGFQVCH LISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLS
Sbjct: 129 CLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLS 188
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Sbjct: 369 GNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDA 428
Query: 374 TA 369
TA
Sbjct: 429 TA 430
>XP_019246153.1 PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Nicotiana attenuata] OIT03809.1
tubulin beta-8 chain [Nicotiana attenuata]
Length = 447
Score = 585 bits (1507), Expect = 0.0
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GNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDA
Sbjct: 369 GNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDA 428
Query: 374 TA 369
TA
Sbjct: 429 TA 430
>XP_018836442.1 PREDICTED: tubulin beta chain-like [Juglans regia]
Length = 447
Score = 585 bits (1507), Expect = 0.0
Identities = 289/302 (95%), Positives = 289/302 (95%)
Frame = -1
Query: 1274 CLQGFQVCHXXXXXXXXXXXXXLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLS 1095
CLQGFQVCH LISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLS
Sbjct: 129 CLQGFQVCHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLS 188
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Query: 374 TA 369
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Sbjct: 429 TA 430