BLASTX nr result
ID: Forsythia23_contig00013205
seq
BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Forsythia23_contig00013205
(832 letters)
Database: ./nr
69,698,275 sequences; 24,982,196,650 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
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ref|XP_010520236.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Tarena... 241 e-116
ref|XP_010542657.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Tarena... 241 e-116
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malaccensis]
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CICLE_v10004755mg [Citrus clementina]
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EUTSA_v10004208mg [Eutrema salsugineum]
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gi|334187880|ref|NP_001190373.1| tubulin beta-8 chain
[Arabidopsis thaliana]
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beta-8 chain; AltName: Full=Beta-8-tubulin
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thaliana] gi|332005840|gb|AED93223.1| tubulin beta-8
chain [Arabidopsis thaliana] gi|332005841|gb|AED93224.1|
tubulin beta-8 chain [Arabidopsis thaliana]
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PHAVU_007G070800g [Phaseolus vulgaris]
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>gb|AFN53689.1| putative tubulin beta-1 chain protein [Linum usitatissimum]
gi|695101934|gb|AIS84163.1| beta-tubulin 1a [Linum
usitatissimum] gi|695101936|gb|AIS84164.1| beta-tubulin
1b [Linum usitatissimum]
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LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRY + S
Sbjct: 257 LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTAS 314
Score = 204 bits (520), Expect(2) = e-116
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NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRR
Sbjct: 332 NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRR 391
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KAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLV+EYQQYQDATA
Sbjct: 392 KAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA 430
>ref|XP_002872076.1| tubulin beta-8 [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata]
gi|297317913|gb|EFH48335.1| tubulin beta-8 [Arabidopsis
lyrata subsp. lyrata]
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gi|223549899|gb|EEF51386.1| tubulin beta chain, putative
[Ricinus communis]
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