BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Coptis25_contig00037865
         (510 letters)

Database: ./nr 
           23,641,837 sequences; 8,123,359,852 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

ref|XP_002880150.1| hypothetical protein ARALYDRAFT_483630 [Arab...    73   2e-11
ref|XP_003883549.1| conserved hypothetical protein [Neospora can...    71   1e-10
dbj|BAK04506.1| predicted protein [Hordeum vulgare subsp. vulgare]     68   7e-10
dbj|BAK04672.1| predicted protein [Hordeum vulgare subsp. vulgare]     68   9e-10
dbj|BAK00061.1| predicted protein [Hordeum vulgare subsp. vulgare]     68   9e-10

>ref|XP_002880150.1| hypothetical protein ARALYDRAFT_483630 [Arabidopsis lyrata subsp.
           lyrata] gi|297325989|gb|EFH56409.1| hypothetical protein
           ARALYDRAFT_483630 [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata]
          Length = 737

 Score = 73.2 bits (178), Expect = 2e-11
 Identities = 51/145 (35%), Positives = 74/145 (51%), Gaps = 6/145 (4%)
 Frame = -3

Query: 418 SSSQPSSNLFGTTPATSCDQNSPFNGSGTVSLSFGSTIASDPTTSGAQSYPFSASGTLSL 239
           SS+  SS+   TT   S   N   N S T    FGST++S P +S   S+ F AS + S 
Sbjct: 20  SSATNSSSASSTTSPLSFSFNQSSNPSST-GFGFGSTVSSTPASSTTPSFGFGASSSPSF 78

Query: 238 NFGQSTSASASTPFGTTPATSGSQSSPFIGSGTLCLSFGSTTASVGNSLFGVAPAASGAQ 59
            FG S S++ S  FG++ +T+ + ++P  G GT   S  S  +  G+S    + AA G  
Sbjct: 79  GFGSSASSTPSFGFGSSASTTPASTTPSFGFGTAASSSASAPSLFGSSTTNASSAAPG-- 136

Query: 58  TSPFG------ASGTLSLSFGQSIP 2
           +SPFG      +S T+S S    +P
Sbjct: 137 SSPFGFVTSSASSATVSASSPFGVP 161



 Score = 63.5 bits (153), Expect = 2e-08
 Identities = 59/152 (38%), Positives = 82/152 (53%), Gaps = 23/152 (15%)
 Frame = -3

Query: 415 SSQPSSNLFG------TTPATSCDQNSPFNGSGTVSLSFGSTIASDPTTS-GAQSYPFSA 257
           SS PSS  FG      +TPA+S   +  F  S + S  FGS+ +S P+   G+ +    A
Sbjct: 42  SSNPSSTGFGFGSTVSSTPASSTTPSFGFGASSSPSFGFGSSASSTPSFGFGSSASTTPA 101

Query: 256 SGTLSLNFGQSTSASASTP--FG--TTPATSGSQ-SSPF------IGSGTLCLS--FG-- 122
           S T S  FG + S+SAS P  FG  TT A+S +  SSPF        S T+  S  FG  
Sbjct: 102 STTPSFGFGTAASSSASAPSLFGSSTTNASSAAPGSSPFGFVTSSASSATVSASSPFGVP 161

Query: 121 -STTASVGNSLFGVAPAASGAQTSPFGASGTL 29
            S++A+  +S+FG APA+    +S FG+S +L
Sbjct: 162 ASSSATPSSSIFGAAPAS--GSSSLFGSSSSL 191



 Score = 62.4 bits (150), Expect = 4e-08
 Identities = 54/159 (33%), Positives = 78/159 (49%)
 Frame = -3

Query: 484 SSSYNANMSTPWRYNHPYPRAPSSSQPSSNLFGTTPATSCDQNSPFNGSGTVSLSFGSTI 305
           SS+ +A +S    +  P   A SS+ PSS++FG  PA+    +S F  S ++  +  S  
Sbjct: 145 SSASSATVSASSPFGVP---ASSSATPSSSIFGAAPASG--SSSLFGSSSSLFSAPSSAS 199

Query: 304 ASDPTTSGAQSYPFSASGTLSLNFGQSTSASASTPFGTTPATSGSQSSPFIGSGTLCLSF 125
           AS+ +  GA S   SA+ + S  FG   SA+ STP     +  GS SS F  +G+L    
Sbjct: 200 ASNSSIFGASS---SAATSTSPLFGAPASATGSTPSFGVASAPGSSSSIFGATGSL---- 252

Query: 124 GSTTASVGNSLFGVAPAASGAQTSPFGASGTLSLSFGQS 8
                      F VA +ASG+    FGA+G+    FG S
Sbjct: 253 ---------PSFSVASSASGSSPPIFGATGSSPSIFGSS 282


>ref|XP_003883549.1| conserved hypothetical protein [Neospora caninum Liverpool]
           gi|325117966|emb|CBZ53517.1| conserved hypothetical
           protein [Neospora caninum Liverpool]
          Length = 2893

 Score = 70.9 bits (172), Expect = 1e-10
 Identities = 46/139 (33%), Positives = 81/139 (58%)
 Frame = -3

Query: 436 PYPRAPSSSQPSSNLFGTTPATSCDQNSPFNGSGTVSLSFGSTIASDPTTSGAQSYPFSA 257
           P   +PSSS PSS+   ++P++S   +SP + S + S S  S+ +S P++S + S P S+
Sbjct: 9   PSSSSPSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPS-SSSSSSSPSSSSSSSSPSSS 67

Query: 256 SGTLSLNFGQSTSASASTPFGTTPATSGSQSSPFIGSGTLCLSFGSTTASVGNSLFGVAP 77
           S + S +   S+S+ +S+   ++P++S S SSP   S +  LS  S++ S  +S     P
Sbjct: 68  SSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSLSSSSSSFSSSSS-----P 122

Query: 76  AASGAQTSPFGASGTLSLS 20
           ++S   +SP+ +S + S S
Sbjct: 123 SSSSFSSSPYPSSSSSSSS 141



 Score = 63.2 bits (152), Expect = 2e-08
 Identities = 46/159 (28%), Positives = 88/159 (55%)
 Frame = -3

Query: 484 SSSYNANMSTPWRYNHPYPRAPSSSQPSSNLFGTTPATSCDQNSPFNGSGTVSLSFGSTI 305
           SSS +++ S+    +     + SSS PSS+   ++P++S   +SP + S + S S  S+ 
Sbjct: 2   SSSASSSPSSSSPSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPS-SSSS 60

Query: 304 ASDPTTSGAQSYPFSASGTLSLNFGQSTSASASTPFGTTPATSGSQSSPFIGSGTLCLSF 125
           +S P++S + S P S+S + S +   S+S+ +S+   ++P++S S SS    S +   S 
Sbjct: 61  SSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSLSSSSSSFSSSS 120

Query: 124 GSTTASVGNSLFGVAPAASGAQTSPFGASGTLSLSFGQS 8
             +++S  +S +   P++S + +SP  +S + S S   S
Sbjct: 121 SPSSSSFSSSPY---PSSSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSS 156



 Score = 63.2 bits (152), Expect = 2e-08
 Identities = 49/166 (29%), Positives = 88/166 (53%), Gaps = 4/166 (2%)
 Frame = -3

Query: 487 PSSSYNANMSTPWRYNHPYPRAPSSSQPSSNLFGTTPATSCDQNSPFNGSGTVSLSFGST 308
           PSSS +++  +    +     + SSS PSS+   ++P++S   +SP + S + S S  S+
Sbjct: 28  PSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPS-SSS 86

Query: 307 IASDPTTSGAQSYPFSASGTLSLNFGQSTSASASTP----FGTTPATSGSQSSPFIGSGT 140
            +S P++S + S P S+S + SL+   S+ +S+S+P    F ++P  S S SS    S +
Sbjct: 87  SSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSLSSSSSSFSSSSSPSSSSFSSSPYPSSSSSSSSPSSSS 146

Query: 139 LCLSFGSTTASVGNSLFGVAPAASGAQTSPFGASGTLSLSFGQSIP 2
              S  S+++S  +S      ++S + +S   +S + S S   S P
Sbjct: 147 SSSSSSSSSSSSSSSPSSSPSSSSSSSSSSPSSSPSSSSSSSSSSP 192



 Score = 59.3 bits (142), Expect = 3e-07
 Identities = 46/163 (28%), Positives = 87/163 (53%), Gaps = 3/163 (1%)
 Frame = -3

Query: 487 PSSSYNANMSTPWRYNHPYPRAPSSSQPSSNLFGTTPATSCDQNSPFNGSGTVSLSFGST 308
           PSSS +++  +    +     + SSS PSS+   ++P++S   +SP + S + SLS  S+
Sbjct: 55  PSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSLSSSSS 114

Query: 307 I---ASDPTTSGAQSYPFSASGTLSLNFGQSTSASASTPFGTTPATSGSQSSPFIGSGTL 137
               +S P++S   S P+ +S + S +   S+S+S+S+   ++ ++S S SS    S + 
Sbjct: 115 SFSSSSSPSSSSFSSSPYPSSSSSSSSPSSSSSSSSSS--SSSSSSSSSPSSSPSSSSSS 172

Query: 136 CLSFGSTTASVGNSLFGVAPAASGAQTSPFGASGTLSLSFGQS 8
             S  S++ S  +S    +P++S + +SP  +  + S S   S
Sbjct: 173 SSSSPSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSPSSSSPSSSSS 215



 Score = 56.2 bits (134), Expect = 3e-06
 Identities = 48/177 (27%), Positives = 90/177 (50%), Gaps = 19/177 (10%)
 Frame = -3

Query: 487 PSSSYNANMSTPWRYNHPYPRAPSSSQPSSNLFGTTPATSCDQNSPFNGSGTVSLSFGS- 311
           PSSS +++  +    +     + SSS PSS+   ++P++S   +SP + S + S S  S 
Sbjct: 46  PSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSSS 105

Query: 310 -----------TIASDPTTSGAQSYPF----SASGTLSLNFGQSTSASASTPFGTTPA-- 182
                      + +S P++S   S P+    S+S + S +   S+S+S+S+   ++P+  
Sbjct: 106 SSSLSSSSSSFSSSSSPSSSSFSSSPYPSSSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSSSSSSSPSSS 165

Query: 181 -TSGSQSSPFIGSGTLCLSFGSTTASVGNSLFGVAPAASGAQTSPFGASGTLSLSFG 14
            +S S SS    S +   S  S+++S  +S    +P++S + +SP  +S +  L FG
Sbjct: 166 PSSSSSSSSSSPSSSPSSSSSSSSSSPSSSSSSSSPSSSPSSSSPSSSSSSSPLYFG 222


>dbj|BAK04506.1| predicted protein [Hordeum vulgare subsp. vulgare]
          Length = 502

 Score = 68.2 bits (165), Expect = 7e-10
 Identities = 55/139 (39%), Positives = 71/139 (51%), Gaps = 3/139 (2%)
 Frame = -3

Query: 439 HPYPRAPSSSQPSSNLFGTTPATSCDQNS--PFNGSGTVSLSFGSTIASDPTTSGAQSYP 266
           HP    P+ +QP++      PATS  Q S  P  G+ + +L+  S  AS P+TS   S P
Sbjct: 357 HPTLHLPAPAQPTTQT--AAPATSQPQQSLLPSGGTSSSALAAFSMPASAPSTSSLFSTP 414

Query: 265 FSASGTLSLNFGQSTSASASTPFGTTPA-TSGSQSSPFIGSGTLCLSFGSTTASVGNSLF 89
            ++S T +L FG + SA  STPFGT+   T GS  +P    G +  SF ST A  G SLF
Sbjct: 415 TTSSLTTNL-FGTTGSAQLSTPFGTSSTPTLGSTPTPSGFGGGISPSFPSTPALTGTSLF 473

Query: 88  GVAPAASGAQTSPFGASGT 32
              P   GA  S     GT
Sbjct: 474 S-TPFGGGATASGSSFGGT 491


>dbj|BAK04672.1| predicted protein [Hordeum vulgare subsp. vulgare]
          Length = 908

 Score = 67.8 bits (164), Expect = 9e-10
 Identities = 69/198 (34%), Positives = 92/198 (46%), Gaps = 38/198 (19%)
 Frame = -3

Query: 487 PSSSYNANMSTPWRYNHPYPR----APSSSQPSSNLFGTTPA-----TSCDQNSPFNGS- 338
           PSSS   + STP     P P     A SS   S +LFG  P+     +S  Q+SPF  + 
Sbjct: 102 PSSSPFGS-STPAFGASPAPAFGAGATSSGFGSGSLFGQKPSFGGFGSSPSQSSPFGSTF 160

Query: 337 -------GTVSLSFGSTIASDPTTS---GAQSYPFSASGTLSLNFGQSTSASASTPFG-- 194
                  G  +    +T A   TT+   GA + P   S + SL    ST    STPFG  
Sbjct: 161 QQTQPTFGNSTFGATTTPAFGTTTTPSFGATTTPAFGSTSTSLFGASSTPTFGSTPFGST 220

Query: 193 TTPA-------TSGSQSSPFIGSGTLCL---------SFGSTTASVGNSLFGVAPAASGA 62
           TTP        T G+ S+P  G+ +            SFG T ++ G++ FG  P+  GA
Sbjct: 221 TTPGFGSSGTTTFGASSAPAFGASSTPANAFSFGSSPSFGQTASATGSTPFGTTPSPFGA 280

Query: 61  QTSPFGASGTLSLSFGQS 8
           QTSPFG S T + +FGQ+
Sbjct: 281 QTSPFG-SQTAAPAFGQA 297



 Score = 65.9 bits (159), Expect = 3e-09
 Identities = 56/131 (42%), Positives = 67/131 (51%), Gaps = 19/131 (14%)
 Frame = -3

Query: 421 PSSSQPSSNLFG--TTPATSCDQNSPFNGSGTV---SLSFGSTI-----ASDPTTSGAQS 272
           P+    ++  FG  TTPA      S F  S T    S  FGST      +S  TT GA S
Sbjct: 178 PAFGTTTTPSFGATTTPAFGSTSTSLFGASSTPTFGSTPFGSTTTPGFGSSGTTTFGASS 237

Query: 271 YP-FSASGT--------LSLNFGQSTSASASTPFGTTPATSGSQSSPFIGSGTLCLSFGS 119
            P F AS T         S +FGQ+ SA+ STPFGTTP+  G+Q+SPF GS T   +FG 
Sbjct: 238 APAFGASSTPANAFSFGSSPSFGQTASATGSTPFGTTPSPFGAQTSPF-GSQTAAPAFGQ 296

Query: 118 TTASVGNSLFG 86
             AS GN   G
Sbjct: 297 --ASFGNQSGG 305


>dbj|BAK00061.1| predicted protein [Hordeum vulgare subsp. vulgare]
          Length = 908

 Score = 67.8 bits (164), Expect = 9e-10
 Identities = 69/198 (34%), Positives = 92/198 (46%), Gaps = 38/198 (19%)
 Frame = -3

Query: 487 PSSSYNANMSTPWRYNHPYPR----APSSSQPSSNLFGTTPA-----TSCDQNSPFNGS- 338
           PSSS   + STP     P P     A SS   S +LFG  P+     +S  Q+SPF  + 
Sbjct: 102 PSSSPFGS-STPAFGASPAPAFGAGATSSGFGSGSLFGQKPSFGGFGSSPSQSSPFGSTF 160

Query: 337 -------GTVSLSFGSTIASDPTTS---GAQSYPFSASGTLSLNFGQSTSASASTPFG-- 194
                  G  +    +T A   TT+   GA + P   S + SL    ST    STPFG  
Sbjct: 161 QQTQPTFGNSTFGATTTPAFGTTTTPSFGATTTPAFGSTSTSLFGASSTPTFGSTPFGST 220

Query: 193 TTPA-------TSGSQSSPFIGSGTLCL---------SFGSTTASVGNSLFGVAPAASGA 62
           TTP        T G+ S+P  G+ +            SFG T ++ G++ FG  P+  GA
Sbjct: 221 TTPGFGSSGTTTFGASSAPAFGASSTPANAFSFGSSPSFGQTASATGSTPFGTTPSPFGA 280

Query: 61  QTSPFGASGTLSLSFGQS 8
           QTSPFG S T + +FGQ+
Sbjct: 281 QTSPFG-SQTAAPAFGQA 297



 Score = 65.9 bits (159), Expect = 3e-09
 Identities = 56/131 (42%), Positives = 67/131 (51%), Gaps = 19/131 (14%)
 Frame = -3

Query: 421 PSSSQPSSNLFG--TTPATSCDQNSPFNGSGTV---SLSFGSTI-----ASDPTTSGAQS 272
           P+    ++  FG  TTPA      S F  S T    S  FGST      +S  TT GA S
Sbjct: 178 PAFGTTTTPSFGATTTPAFGSTSTSLFGASSTPTFGSTPFGSTTTPGFGSSGTTTFGASS 237

Query: 271 YP-FSASGT--------LSLNFGQSTSASASTPFGTTPATSGSQSSPFIGSGTLCLSFGS 119
            P F AS T         S +FGQ+ SA+ STPFGTTP+  G+Q+SPF GS T   +FG 
Sbjct: 238 APAFGASSTPANAFSFGSSPSFGQTASATGSTPFGTTPSPFGAQTSPF-GSQTAAPAFGQ 296

Query: 118 TTASVGNSLFG 86
             AS GN   G
Sbjct: 297 --ASFGNQSGG 305