BLASTX nr result

ID: Coptis23_contig00015159 seq

BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Coptis23_contig00015159
         (1080 letters)

Database: ./nr 
           23,641,837 sequences; 8,123,359,852 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

emb|CCE41950.1| hypothetical protein CPAR2_804990 [Candida parap...    61   4e-07
gb|EGD75653.1| NOTCH2 protein [Salpingoeca sp. ATCC 50818]             61   5e-07

>emb|CCE41950.1| hypothetical protein CPAR2_804990 [Candida parapsilosis]
          Length = 955

 Score = 61.2 bits (147), Expect = 4e-07
 Identities = 101/375 (26%), Positives = 161/375 (42%), Gaps = 20/375 (5%)
 Frame = -1

Query: 1071 SCDSGPSFQSLASETSASCPVETPSTIF-LLHTTSC*WFSSRTLGNRATSP-LSLVTLDR 898
            S  S PS QS +  TS S    TPST+  L+ TT+    +  T G+  ++P  S+ T   
Sbjct: 89   SFPSSPS-QSTSETTSFSSSESTPSTVSSLIPTTTSDPTTPPTQGSSESTPSTSVPTSSS 147

Query: 897  RPECAPSERQL*SFISAVASPQQVLGD----TSDFTGRLFLVAV---TISSGSSSEGTYA 739
             P  +PS     SF+S+ +S           TSDF+      +V   T  S +SS  + A
Sbjct: 148  VPTESPSTS---SFVSSSSSSSYTSSSSSPTTSDFSSSSMSSSVPTETTPSTTSSSSSSA 204

Query: 738  GLESLLNSIE*PAST-----SSF*FSMPDLIVEFTSTGELSSEEHTFTIAPDSTGNEHVP 574
             L +  +S   P+ST     SS  FS   L    +S   +SS     T+ P S+  E   
Sbjct: 205  SLPTTTSSETTPSSTSLVEPSSTEFSSDPLPSSSSSDTSISSSSD--TLIPSSSSEESTS 262

Query: 573  DRTSFTGAFCPKASVSISFKSTTKSMGKAMFV------LLASLTSGPSIFCKSATPSNSL 412
              T+         S S SF+S+T S   + F+      + +S +   S    S T S+S 
Sbjct: 263  SSTT--------ESSSSSFESSTTSTESSSFIPSSTSEISSSTSESSSSSFSSETSSSSF 314

Query: 411  LADSWNRGSSTDKFPFESRFSSVSTTFAI*TSSGPSFFINTAEAQPFASCTWKVDDLTSL 232
             +D+ +  S +        FSS S + +    S  +F  +++E   F+S T   D ++S 
Sbjct: 315  SSDTTSTSSES--------FSSSSLSESSSEFSSSTFESSSSETSSFSSST--SDQISSS 364

Query: 231  SETRPTTESTVDLVE*YLNCASPSN*DTTFFKASGVLDELSSFGVSDNWIPKLLLRLRSA 52
            S T  ++ S     E   + +  +   ++  ++S  +   SS   + +       R RS+
Sbjct: 365  SSTEESSTSETSSSEPSSSSSEETTSSSSSEESSTAIATTSSRSSTTSSASSSSSRTRSS 424

Query: 51   SEKSLTASENSSSSD 7
            S  S T  E SS+ D
Sbjct: 425  SSPSST-EEPSSTED 438


>gb|EGD75653.1| NOTCH2 protein [Salpingoeca sp. ATCC 50818]
          Length = 4350

 Score = 60.8 bits (146), Expect = 5e-07
 Identities = 83/351 (23%), Positives = 143/351 (40%)
 Frame = -1

Query: 1062 SGPSFQSLASETSASCPVETPSTIFLLHTTSC*WFSSRTLGNRATSPLSLVTLDRRPECA 883
            S  S+ S ++ TS+S    T +      ++S   FSS T  + ++S  S  T D  P  A
Sbjct: 3086 STSSYTSTSTSTSSSTSSYTSTFSSTSSSSSSSTFSS-TSSSTSSSTSSTTTTDAWPTSA 3144

Query: 882  PSERQL*SFISAVASPQQVLGDTSDFTGRLFLVAVTISSGSSSEGTYAGLESLLNSIE*P 703
            PS     S  S+ +S       T+  T    +   T SS S+S  T +   S L++    
Sbjct: 3145 PST----SSSSSTSSSTSSSVSTTTTTITTGVPGSTSSSSSTSSSTSSSTSSSLSTATQG 3200

Query: 702  ASTSSF*FSMPDLIVEFTSTGELSSEEHTFTIAPDSTGNEHVPDRTSFTGAFCPKASVSI 523
             + S+   S        +ST E  S   T + +  ST +   P  TS + +     S ++
Sbjct: 3201 DAPSTSSSSSSSTSSSTSSTTETPSFPSTSSSSSSSTSSTFTPPTTSSSSSTSSSTSTTL 3260

Query: 522  SFKSTTKSMGKAMFVLLASLTSGPSIFCKSATPSNSLLADSWNRGSSTDKFPFESRFSSV 343
            S  +++ +         ++ TSG   F  S+T +++  + S +  SST      S  SS 
Sbjct: 3261 STSTSSST---------STSTSGVISFSASSTSTSTSSSSSTSSSSSTSLSTSTSTSSST 3311

Query: 342  STTFAI*TSSGPSFFINTAEAQPFASCTWKVDDLTSLSETRPTTESTVDLVE*YLNCASP 163
            ST+    TSS  +   +++ +   +S T      ++ S T  +T S+           S 
Sbjct: 3312 STSQTTSTSSSTTSSTSSSTSSSISSSTSSTTSSSTSSSTSTSTSSSSSSSTTTSTSTST 3371

Query: 162  SN*DTTFFKASGVLDELSSFGVSDNWIPKLLLRLRSASEKSLTASENSSSS 10
            ++  +T    S      +S   S +          ++S  S T S ++SSS
Sbjct: 3372 TSSSSTSTSTSTSTSTSTSSSSSSSSSSSTSTSTSTSSSSSTTTSTSTSSS 3422


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