BLASTX nr result
ID: Cocculus23_contig00005972
seq
BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Cocculus23_contig00005972
(1083 letters)
Database: ./nr
38,876,450 sequences; 13,856,398,315 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
ref|XP_004172348.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumi... 527 e-147
ref|XP_004147894.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumi... 527 e-147
sp|Q8H7U1.1|TBB2_ORYSJ RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltNa... 525 e-146
ref|XP_006649228.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Oryza ... 525 e-146
ref|XP_006339000.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like [Solanu... 525 e-146
ref|XP_007016239.1| Tubulin beta 8 [Theobroma cacao] gi|50878660... 525 e-146
gb|EMT08428.1| Tubulin beta-1 chain [Aegilops tauschii] 525 e-146
ref|XP_004249594.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu... 525 e-146
ref|XP_004249588.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu... 525 e-146
ref|XP_002468688.1| hypothetical protein SORBIDRAFT_01g050310 [S... 525 e-146
gb|EEE58163.1| hypothetical protein OsJ_09084 [Oryza sativa Japo... 525 e-146
gb|EEC74344.1| hypothetical protein OsI_09642 [Oryza sativa Indi... 525 e-146
gb|ABY86665.1| beta-tubulin 19 [Gossypium hirsutum] 525 e-146
emb|CAM58986.1| beta tubulin 8 [Hordeum vulgare subsp. vulgare] ... 525 e-146
ref|XP_004986075.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Setari... 525 e-146
ref|XP_006490393.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Citrus... 525 e-146
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ref|XP_006421924.1| hypothetical protein CICLE_v10004755mg [Citr... 525 e-146
ref|XP_004241186.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu... 525 e-146
gb|EXC19132.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis] 524 e-146
>ref|XP_004172348.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumis sativus]
Length = 446
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>ref|XP_004147894.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumis sativus]
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>sp|Q8H7U1.1|TBB2_ORYSJ RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltName: Full=Beta-2-tubulin
gi|24418032|gb|AAN60482.1| Putative beta tubulin [Oryza
sativa Japonica Group] gi|108705732|gb|ABF93527.1|
Tubulin beta-2 chain, putative, expressed [Oryza sativa
Japonica Group] gi|215769447|dbj|BAH01676.1| unnamed
protein product [Oryza sativa Japonica Group]
Length = 447
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Tubulin beta 8 [Theobroma cacao]
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>ref|XP_004249594.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum]
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>ref|XP_004249588.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum]
Length = 448
Score = 525 bits (1352), Expect = e-146
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>ref|XP_002468688.1| hypothetical protein SORBIDRAFT_01g050310 [Sorghum bicolor]
gi|241922542|gb|EER95686.1| hypothetical protein
SORBIDRAFT_01g050310 [Sorghum bicolor]
gi|414864264|tpg|DAA42821.1| TPA: beta tubulin1 isoform
1 [Zea mays] gi|414864265|tpg|DAA42822.1| TPA: beta
tubulin1 isoform 2 [Zea mays]
Length = 446
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GMDEMEFTEAESNMNDL
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>gb|EEE58163.1| hypothetical protein OsJ_09084 [Oryza sativa Japonica Group]
Length = 480
Score = 525 bits (1352), Expect = e-146
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Frame = +3
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Sbjct: 195 RMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPS 254
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Sbjct: 255 FGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQY 314
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>gb|ABY86665.1| beta-tubulin 19 [Gossypium hirsutum]
Length = 444
Score = 525 bits (1352), Expect = e-146
Identities = 257/257 (100%), Positives = 257/257 (100%)
Frame = +3
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>emb|CAM58986.1| beta tubulin 8 [Hordeum vulgare subsp. vulgare]
gi|326524376|dbj|BAK00571.1| predicted protein [Hordeum
vulgare subsp. vulgare] gi|473938525|gb|EMS50212.1|
Tubulin beta-2 chain [Triticum urartu]
Length = 447
Score = 525 bits (1352), Expect = e-146
Identities = 257/257 (100%), Positives = 257/257 (100%)
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GMDEMEFTEAESNMNDL
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>ref|XP_004986075.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Setaria italica]
gi|51988178|emb|CAE52517.1| beta tubulin [Setaria
viridis]
Length = 448
Score = 525 bits (1352), Expect = e-146
Identities = 257/257 (100%), Positives = 257/257 (100%)
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>ref|XP_006490393.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Citrus sinensis]
Length = 446
Score = 525 bits (1351), Expect = e-146
Identities = 258/273 (94%), Positives = 260/273 (95%)
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GMDEMEFTEAESNMNDL E +Y
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>ref|XP_006350813.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Solanum tuberosum]
Length = 446
Score = 525 bits (1351), Expect = e-146
Identities = 256/257 (99%), Positives = 257/257 (100%)
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RALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYF
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GMDEMEFTEAESNMNDL
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>ref|XP_006421924.1| hypothetical protein CICLE_v10004755mg [Citrus clementina]
gi|557523797|gb|ESR35164.1| hypothetical protein
CICLE_v10004755mg [Citrus clementina]
Length = 514
Score = 525 bits (1351), Expect = e-146
Identities = 258/273 (94%), Positives = 260/273 (95%)
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GMDEMEFTEAESNMNDL E +Y
Sbjct: 470 GMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEDY 502
>ref|XP_004241186.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum]
Length = 446
Score = 525 bits (1351), Expect = e-146
Identities = 256/257 (99%), Positives = 257/257 (100%)
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Sbjct: 342 IEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGE 401
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GMDEMEFTEAESNMNDL
Sbjct: 402 GMDEMEFTEAESNMNDL 418
>gb|EXC19132.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis]
Length = 447
Score = 524 bits (1350), Expect = e-146
Identities = 256/257 (99%), Positives = 257/257 (100%)
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Sbjct: 402 GMDEMEFTEAESNMNDL 418