BLASTX nr result
ID: Cnidium21_contig00008311
seq
BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= Cnidium21_contig00008311 (761 letters) Database: ./nr 23,641,837 sequences; 8,123,359,852 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value ref|XP_003604816.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|... 515 e-144 ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|... 514 e-144 ref|XP_003604818.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|... 514 e-144 ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachy... 514 e-143 ref|XP_003520939.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Glycin... 514 e-143 >ref|XP_003604816.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|355505871|gb|AES87013.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] Length = 449 Score = 515 bits (1327), Expect = e-144 Identities = 251/253 (99%), Positives = 253/253 (100%) Frame = +1 Query: 1 SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG 180 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514 bits (1325), Expect = e-144 Identities = 251/253 (99%), Positives = 253/253 (100%) Frame = +1 Query: 1 SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG 180 SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG Sbjct: 176 SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG 235 Query: 181 VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWD 360 VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRAL+VPELTQQMWD Sbjct: 236 VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWD 295 Query: 361 SKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD 540 SKNMMCAADPRHGRYLTASA+FRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD Sbjct: 296 SKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD 355 Query: 541 IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 720 IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM Sbjct: 356 IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 415 Query: 721 NDLVSEYQQYQDA 759 NDLVSEYQQYQDA Sbjct: 416 NDLVSEYQQYQDA 428 >ref|XP_003604818.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|355505873|gb|AES87015.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|388519653|gb|AFK47888.1| unknown [Medicago truncatula] Length = 449 Score = 514 bits (1324), Expect = e-144 Identities = 249/253 (98%), Positives = 253/253 (100%) Frame = +1 Query: 1 SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG 180 SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG Sbjct: 176 SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG 235 Query: 181 VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWD 360 VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNL+PFPRLHFFM+GFAPLTSRGSQQYRALSVPE+TQQMWD Sbjct: 236 VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLVPFPRLHFFMLGFAPLTSRGSQQYRALSVPEITQQMWD 295 Query: 361 SKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD 540 SKNMMCAADPRHGRYLTASA+FRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD Sbjct: 296 SKNMMCAADPRHGRYLTASAIFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD 355 Query: 541 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