BLASTX nr result

ID: Cnidium21_contig00008311 seq

BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Cnidium21_contig00008311
         (761 letters)

Database: ./nr 
           23,641,837 sequences; 8,123,359,852 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

ref|XP_003604816.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|...   515   e-144
ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|...   514   e-144
ref|XP_003604818.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|...   514   e-144
ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachy...   514   e-143
ref|XP_003520939.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Glycin...   514   e-143

>ref|XP_003604816.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula]
           gi|355505871|gb|AES87013.1| Tubulin beta chain [Medicago
           truncatula]
          Length = 449

 Score =  515 bits (1327), Expect = e-144
 Identities = 251/253 (99%), Positives = 253/253 (100%)
 Frame = +1

Query: 1   SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG 180
           SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG
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Query: 181 VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWD 360
           VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFM+GFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWD
Sbjct: 236 VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMLGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWD 295

Query: 361 SKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD 540
           SKNMMCAADPRHGRYLTASA+FRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD
Sbjct: 296 SKNMMCAADPRHGRYLTASAIFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD 355

Query: 541 IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 720
           IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM
Sbjct: 356 IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 415

Query: 721 NDLVSEYQQYQDA 759
           NDLVSEYQQYQDA
Sbjct: 416 NDLVSEYQQYQDA 428


>ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula]
           gi|355481332|gb|AES62535.1| Tubulin beta chain [Medicago
           truncatula]
          Length = 449

 Score =  514 bits (1325), Expect = e-144
 Identities = 251/253 (99%), Positives = 253/253 (100%)
 Frame = +1

Query: 1   SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG 180
           SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG
Sbjct: 176 SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG 235

Query: 181 VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWD 360
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Query: 361 SKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD 540
           SKNMMCAADPRHGRYLTASA+FRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD
Sbjct: 296 SKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD 355

Query: 541 IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 720
           IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM
Sbjct: 356 IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 415

Query: 721 NDLVSEYQQYQDA 759
           NDLVSEYQQYQDA
Sbjct: 416 NDLVSEYQQYQDA 428


>ref|XP_003604818.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula]
           gi|355505873|gb|AES87015.1| Tubulin beta chain [Medicago
           truncatula] gi|388519653|gb|AFK47888.1| unknown
           [Medicago truncatula]
          Length = 449

 Score =  514 bits (1324), Expect = e-144
 Identities = 249/253 (98%), Positives = 253/253 (100%)
 Frame = +1

Query: 1   SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG 180
           SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG
Sbjct: 176 SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG 235

Query: 181 VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWD 360
           VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNL+PFPRLHFFM+GFAPLTSRGSQQYRALSVPE+TQQMWD
Sbjct: 236 VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLVPFPRLHFFMLGFAPLTSRGSQQYRALSVPEITQQMWD 295

Query: 361 SKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD 540
           SKNMMCAADPRHGRYLTASA+FRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD
Sbjct: 296 SKNMMCAADPRHGRYLTASAIFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD 355

Query: 541 IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 720
           IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM
Sbjct: 356 IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 415

Query: 721 NDLVSEYQQYQDA 759
           NDLVSEYQQYQDA
Sbjct: 416 NDLVSEYQQYQDA 428


>ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachypodium distachyon]
          Length = 448

 Score =  514 bits (1323), Expect = e-143
 Identities = 250/253 (98%), Positives = 253/253 (100%)
 Frame = +1

Query: 1   SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG 180
           SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG
Sbjct: 177 SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG 236

Query: 181 VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWD 360
           VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRAL+VPELTQQMWD
Sbjct: 237 VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWD 296

Query: 361 SKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD 540
           SKNMMCAADPRHGRYLTASA+FRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD
Sbjct: 297 SKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD 356

Query: 541 IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 720
           IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM
Sbjct: 357 IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 416

Query: 721 NDLVSEYQQYQDA 759
           NDLVSEYQQYQDA
Sbjct: 417 NDLVSEYQQYQDA 429


>ref|XP_003520939.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Glycine max]
          Length = 449

 Score =  514 bits (1323), Expect = e-143
 Identities = 251/253 (99%), Positives = 253/253 (100%)
 Frame = +1

Query: 1   SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG 180
           SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG
Sbjct: 176 SDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSG 235

Query: 181 VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWD 360
           VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWD
Sbjct: 236 VTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWD 295

Query: 361 SKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCD 540
           SKNMMCAADPRHGRYLTASA+FRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIP+NVKSTVCD
Sbjct: 296 SKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPHNVKSTVCD 355

Query: 541 IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 720
           IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM
Sbjct: 356 IPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 415

Query: 721 NDLVSEYQQYQDA 759
           NDLVSEYQQYQDA
Sbjct: 416 NDLVSEYQQYQDA 428


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