BLASTX nr result
ID: Cinnamomum23_contig00009719
seq
BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Cinnamomum23_contig00009719
(1192 letters)
Database: ./nr
69,698,275 sequences; 24,982,196,650 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
ref|XP_008782284.1| PREDICTED: tubulin beta-6 chain-like [Phoeni... 489 e-135
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ref|XP_011075464.1| PREDICTED: tubulin beta-5 chain isoform X1 [... 488 e-135
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ref|XP_010673063.1| PREDICTED: tubulin beta-6 chain isoform X1 [... 488 e-135
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ref|XP_012091234.1| PREDICTED: tubulin beta-5 chain [Jatropha cu... 488 e-135
ref|NP_001140291.1| uncharacterized protein LOC100272336 [Zea ma... 488 e-135
ref|XP_002523246.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus commun... 488 e-135
gb|EEE55549.1| hypothetical protein OsJ_03802 [Oryza sativa Japo... 488 e-135
gb|EEC71666.1| hypothetical protein OsI_04129 [Oryza sativa Indi... 488 e-135
gb|ACG32188.1| tubulin beta-4 chain [Zea mays] 488 e-135
>ref|XP_008782284.1| PREDICTED: tubulin beta-6 chain-like [Phoenix dactylifera]
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>ref|XP_010088982.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis] gi|587846738|gb|EXB37197.1|
Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis]
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>ref|NP_001105317.1| tubulin beta-6 chain [Zea mays] gi|670385151|ref|XP_008673429.1|
PREDICTED: tubulin beta-6 chain isoform X1 [Zea mays]
gi|8928414|sp|Q41783.1|TBB6_MAIZE RecName: Full=Tubulin
beta-6 chain; AltName: Full=Beta-6-tubulin
gi|416147|gb|AAA20186.1| beta-6 tubulin [Zea mays]
gi|219885629|gb|ACL53189.1| unknown [Zea mays]
gi|414880069|tpg|DAA57200.1| TPA: beta tubulin6 isoform 1
[Zea mays] gi|414880070|tpg|DAA57201.1| TPA: beta
tubulin6 isoform 2 [Zea mays]
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>ref|XP_011079080.1| PREDICTED: tubulin beta-5 chain-like [Sesamum indicum]
gi|747064944|ref|XP_011079081.1| PREDICTED: tubulin
beta-5 chain-like [Sesamum indicum]
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>ref|XP_011075465.1| PREDICTED: tubulin beta-5 chain isoform X2 [Sesamum indicum]
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>ref|XP_010922039.1| PREDICTED: tubulin beta-5 chain [Elaeis guineensis]
gi|743785924|ref|XP_010922040.1| PREDICTED: tubulin
beta-5 chain [Elaeis guineensis]
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>ref|XP_010673064.1| PREDICTED: tubulin beta-6 chain isoform X2 [Beta vulgaris subsp.
vulgaris] gi|731324614|ref|XP_010673065.1| PREDICTED:
tubulin beta-6 chain isoform X2 [Beta vulgaris subsp.
vulgaris] gi|870864085|gb|KMT15218.1| hypothetical
protein BVRB_3g063290 [Beta vulgaris subsp. vulgaris]
Length = 445
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>ref|XP_010673063.1| PREDICTED: tubulin beta-6 chain isoform X1 [Beta vulgaris subsp.
vulgaris]
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gi|698552255|ref|XP_009769578.1| PREDICTED: tubulin
beta-1 chain [Nicotiana sylvestris]
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Length = 447
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NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDAT
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>ref|XP_009403832.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Musa acuminata subsp.
malaccensis]
Length = 447
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>ref|XP_012073488.1| PREDICTED: tubulin beta-5 chain-like [Jatropha curcas]
gi|643729057|gb|KDP36971.1| hypothetical protein
JCGZ_08563 [Jatropha curcas]
Length = 447
Score = 488 bits (1255), Expect = e-135
Identities = 237/240 (98%), Positives = 239/240 (99%)
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>ref|XP_012091234.1| PREDICTED: tubulin beta-5 chain [Jatropha curcas]
gi|643704525|gb|KDP21557.1| hypothetical protein
JCGZ_03665 [Jatropha curcas]
Length = 447
Score = 488 bits (1255), Expect = e-135
Identities = 237/240 (98%), Positives = 239/240 (99%)
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>ref|NP_001140291.1| uncharacterized protein LOC100272336 [Zea mays]
gi|223948159|gb|ACN28163.1| unknown [Zea mays]
Length = 379
Score = 488 bits (1255), Expect = e-135
Identities = 237/240 (98%), Positives = 239/240 (99%)
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>ref|XP_002523246.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis]
gi|223537542|gb|EEF39167.1| tubulin beta chain, putative
[Ricinus communis]
Length = 414
Score = 488 bits (1255), Expect = e-135
Identities = 237/240 (98%), Positives = 239/240 (99%)
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Sbjct: 218 LRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGR 277
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Sbjct: 278 YLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFIG 337
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>gb|EEE55549.1| hypothetical protein OsJ_03802 [Oryza sativa Japonica Group]
Length = 382
Score = 488 bits (1255), Expect = e-135
Identities = 237/240 (98%), Positives = 239/240 (99%)
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Sbjct: 305 NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDAT 364
>gb|EEC71666.1| hypothetical protein OsI_04129 [Oryza sativa Indica Group]
Length = 496
Score = 488 bits (1255), Expect = e-135
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Frame = -3
Query: 1190 HQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLSTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSD 1011
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Sbjct: 239 HQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSD 298
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Sbjct: 299 LRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGR 358
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Sbjct: 359 YLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFIG 418
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NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDAT
Sbjct: 419 NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDAT 478
>gb|ACG32188.1| tubulin beta-4 chain [Zea mays]
Length = 446
Score = 488 bits (1255), Expect = e-135
Identities = 237/240 (98%), Positives = 239/240 (99%)
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HQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKL+TPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSD
Sbjct: 190 HQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSD 249
Query: 1010 LRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQHYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGR 831
LRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQ YRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGR
Sbjct: 250 LRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGR 309
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YLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCD+PPRGLSMASTFIG
Sbjct: 310 YLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFIG 369
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NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDAT
Sbjct: 370 NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDAT 429