BLASTX nr result
ID: Catharanthus22_contig00005229
seq
BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Catharanthus22_contig00005229
(1088 letters)
Database: ./nr
37,332,560 sequences; 13,225,080,153 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gb|EPS57653.1| beta-tubulin, partial [Genlisea aurea] 465 e-128
gb|ABB16968.1| beta-tubulin-like protein [Solanum tuberosum] 465 e-128
ref|NP_001234807.1| beta-tubulin [Solanum lycopersicum] gi|77963... 465 e-128
ref|XP_002510540.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus commun... 465 e-128
ref|NP_001275378.1| beta-tubulin-like protein [Solanum tuberosum... 465 e-128
gb|ABP65322.1| beta tubulin [Capsicum annuum] 465 e-128
gb|AAR37366.1| beta-tubulin [Nicotiana attenuata] 465 e-128
ref|XP_006473665.1| PREDICTED: tubulin beta-6 chain-like [Citrus... 464 e-128
ref|XP_006435187.1| hypothetical protein CICLE_v10001140mg [Citr... 464 e-128
gb|EOY15034.1| Tubulin beta-1 chain [Theobroma cacao] 463 e-128
gb|EXC00991.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis] 462 e-128
ref|XP_004152649.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumi... 462 e-128
ref|XP_002275306.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Vitis vinif... 462 e-128
gb|ABS50667.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis] 462 e-128
ref|XP_004291357.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Fragar... 462 e-127
gb|EMJ23296.1| hypothetical protein PRUPE_ppa005644mg [Prunus pe... 462 e-127
ref|XP_006481398.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain [Citrus sine... 461 e-127
ref|XP_006429261.1| hypothetical protein CICLE_v10011723mg [Citr... 461 e-127
gb|AHB86962.1| beta-tubulin [Sedum alfredii] 461 e-127
gb|EXB30492.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis] 460 e-127
>gb|EPS57653.1| beta-tubulin, partial [Genlisea aurea]
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>gb|ABB16968.1| beta-tubulin-like protein [Solanum tuberosum]
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>ref|NP_001234807.1| beta-tubulin [Solanum lycopersicum] gi|77963735|gb|ABB13293.1|
beta-tubulin [Solanum lycopersicum]
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>ref|XP_002510540.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis]
gi|223551241|gb|EEF52727.1| tubulin beta chain, putative
[Ricinus communis]
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>ref|NP_001275378.1| beta-tubulin-like protein [Solanum tuberosum]
gi|197320852|gb|ACH68564.1| beta-tubulin [Solanum
tuberosum]
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>gb|ABP65322.1| beta tubulin [Capsicum annuum]
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>gb|AAR37366.1| beta-tubulin [Nicotiana attenuata]
Length = 450
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>ref|XP_006473665.1| PREDICTED: tubulin beta-6 chain-like [Citrus sinensis]
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>ref|XP_006435187.1| hypothetical protein CICLE_v10001140mg [Citrus clementina]
gi|557537309|gb|ESR48427.1| hypothetical protein
CICLE_v10001140mg [Citrus clementina]
Length = 448
Score = 464 bits (1194), Expect = e-128
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Frame = +3
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QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEY
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>gb|EOY15034.1| Tubulin beta-1 chain [Theobroma cacao]
Length = 451
Score = 463 bits (1191), Expect = e-128
Identities = 225/228 (98%), Positives = 227/228 (99%)
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Sbjct: 377 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEY 424
>gb|EXC00991.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis]
Length = 448
Score = 462 bits (1190), Expect = e-128
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QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEY
Sbjct: 377 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEY 424
>ref|XP_004152649.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumis sativus]
Length = 449
Score = 462 bits (1190), Expect = e-128
Identities = 224/228 (98%), Positives = 227/228 (99%)
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QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEY
Sbjct: 377 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEY 424
>ref|XP_002275306.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Vitis vinifera]
Length = 448
Score = 462 bits (1190), Expect = e-128
Identities = 224/228 (98%), Positives = 227/228 (99%)
Frame = +3
Query: 3 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLSTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 182
NADECMVLDNEALYDICFRTLKLSTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA
Sbjct: 197 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLSTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 256
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VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYISLTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTAS
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>gb|ABS50667.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis]
Length = 444
Score = 462 bits (1190), Expect = e-128
Identities = 224/228 (98%), Positives = 227/228 (99%)
Frame = +3
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NADECMVLDNEALYDICFRTLKLSTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA
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>ref|XP_004291357.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Fragaria vesca subsp. vesca]
Length = 449
Score = 462 bits (1188), Expect = e-127
Identities = 224/228 (98%), Positives = 227/228 (99%)
Frame = +3
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>gb|EMJ23296.1| hypothetical protein PRUPE_ppa005644mg [Prunus persica]
Length = 450
Score = 462 bits (1188), Expect = e-127
Identities = 224/228 (98%), Positives = 227/228 (99%)
Frame = +3
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Sbjct: 257 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYISLTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTAS 316
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QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEY
Sbjct: 377 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEY 424
>ref|XP_006481398.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain [Citrus sinensis]
Length = 432
Score = 461 bits (1187), Expect = e-127
Identities = 224/228 (98%), Positives = 227/228 (99%)
Frame = +3
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VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQY SLTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTAS
Sbjct: 255 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRSLTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTAS 314
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Query: 543 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEY 686
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Sbjct: 375 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEY 422
>ref|XP_006429261.1| hypothetical protein CICLE_v10011723mg [Citrus clementina]
gi|557531318|gb|ESR42501.1| hypothetical protein
CICLE_v10011723mg [Citrus clementina]
Length = 445
Score = 461 bits (1187), Expect = e-127
Identities = 224/228 (98%), Positives = 227/228 (99%)
Frame = +3
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Sbjct: 255 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRSLTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTAS 314
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Sbjct: 315 AMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 374
Query: 543 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEY 686
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Sbjct: 375 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEY 422
>gb|AHB86962.1| beta-tubulin [Sedum alfredii]
Length = 443
Score = 461 bits (1185), Expect = e-127
Identities = 223/228 (97%), Positives = 227/228 (99%)
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Sbjct: 255 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYSSLTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTAS 314
Query: 363 AMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLRMASTFIGNSTSI 542
AMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKS+VCDIPPTGL+MASTFIGNSTSI
Sbjct: 315 AMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 374
Query: 543 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEY 686
QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLV+EY
Sbjct: 375 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEY 422
>gb|EXB30492.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis]
Length = 448
Score = 460 bits (1184), Expect = e-127
Identities = 222/228 (97%), Positives = 227/228 (99%)
Frame = +3
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NADECMVLDNEALYDICFRTLKLSTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA
Sbjct: 195 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLSTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 254
Query: 183 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYISLTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTAS 362
VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQY +LTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTAS
Sbjct: 255 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTAS 314
Query: 363 AMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLRMASTFIGNSTSI 542
AMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKS+VCD+PPTGL+MASTFIGNSTSI
Sbjct: 315 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDVPPTGLKMASTFIGNSTSI 374
Query: 543 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEY 686
QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEY
Sbjct: 375 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEY 422