BLASTX nr result
ID: Catharanthus22_contig00000009
seq
BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Catharanthus22_contig00000009
(1519 letters)
Database: ./nr
37,332,560 sequences; 13,225,080,153 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
ref|XP_002510784.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus commun... 762 0.0
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ref|XP_006421924.1| hypothetical protein CICLE_v10004755mg [Citr... 761 0.0
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ref|XP_002283056.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Vitis vinif... 761 0.0
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ref|NP_001105317.1| tubulin beta-6 chain [Zea mays] gi|8928414|s... 761 0.0
ref|NP_001044565.1| Os01g0805900 [Oryza sativa Japonica Group] g... 761 0.0
ref|XP_004970293.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: tubulin beta... 761 0.0
ref|NP_001239638.1| beta-tubulin [Glycine max] gi|62546343|gb|AA... 761 0.0
pir||JC2510 beta-tubulin R1623 - rice 761 0.0
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ref|XP_003554108.1| PREDICTED: tubulin beta-4 chain-like [Glycin... 761 0.0
ref|XP_003624927.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|... 761 0.0
ref|XP_003624926.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|... 761 0.0
gb|EEC71666.1| hypothetical protein OsI_04129 [Oryza sativa Indi... 761 0.0
ref|NP_001167651.1| uncharacterized protein LOC100381281 [Zea ma... 761 0.0
ref|XP_002270069.1| PREDICTED: tubulin beta-4 chain [Vitis vinif... 761 0.0
emb|CAE52516.1| beta tubulin [Setaria viridis] 761 0.0
gb|EXC19132.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis] 760 0.0
>ref|XP_002510784.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis]
gi|223549899|gb|EEF51386.1| tubulin beta chain, putative
[Ricinus communis]
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>ref|XP_006490393.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Citrus sinensis]
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>ref|XP_006421924.1| hypothetical protein CICLE_v10004755mg [Citrus clementina]
gi|557523797|gb|ESR35164.1| hypothetical protein
CICLE_v10004755mg [Citrus clementina]
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>gb|ABY86655.1| beta-tubulin 4 [Gossypium hirsutum]
Length = 448
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Frame = +2
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Sbjct: 387 AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE 421
>ref|XP_002283056.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Vitis vinifera]
gi|147819028|emb|CAN64894.1| hypothetical protein
VITISV_029111 [Vitis vinifera]
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AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE
Sbjct: 387 AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE 421
>gb|EXB37197.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis]
Length = 446
Score = 761 bits (1964), Expect = 0.0
Identities = 373/395 (94%), Positives = 377/395 (95%)
Frame = +2
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ISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEA
Sbjct: 147 MGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEA 206
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Sbjct: 267 MVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEV 326
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Sbjct: 387 AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE 421
>ref|NP_001105317.1| tubulin beta-6 chain [Zea mays] gi|8928414|sp|Q41783.1|TBB6_MAIZE
RecName: Full=Tubulin beta-6 chain; AltName:
Full=Beta-6-tubulin gi|416147|gb|AAA20186.1| beta-6
tubulin [Zea mays] gi|219885629|gb|ACL53189.1| unknown
[Zea mays] gi|414880069|tpg|DAA57200.1| TPA: beta
tubulin6 isoform 1 [Zea mays]
gi|414880070|tpg|DAA57201.1| TPA: beta tubulin6 isoform 2
[Zea mays]
Length = 446
Score = 761 bits (1964), Expect = 0.0
Identities = 373/395 (94%), Positives = 377/395 (95%)
Frame = +2
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EHGID +GRY G++DLQLERVNVYYNEASCGRFVPRAVLMDLEPGTMDSVRTGPYGQIFR
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ISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEA
Sbjct: 147 MGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEA 206
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DEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDI P+GLSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFT
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AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE
Sbjct: 387 AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE 421
>ref|NP_001044565.1| Os01g0805900 [Oryza sativa Japonica Group]
gi|1174598|sp|P45960.1|TBB4_ORYSJ RecName: Full=Tubulin
beta-4 chain; AltName: Full=Beta-4-tubulin
gi|493708|dbj|BAA06381.1| beta-tubulin [Oryza sativa
Japonica Group] gi|20804582|dbj|BAB92274.1| beta-tubulin
[Oryza sativa Japonica Group]
gi|113534096|dbj|BAF06479.1| Os01g0805900 [Oryza sativa
Japonica Group] gi|215704162|dbj|BAG93002.1| unnamed
protein product [Oryza sativa Japonica Group]
Length = 447
Score = 761 bits (1964), Expect = 0.0
Identities = 373/395 (94%), Positives = 377/395 (95%)
Frame = +2
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EHGID +GRY G++DLQLERVNVYYNEASCGRFVPRAVLMDLEPGTMDSVRTGPYGQIFR
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PDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELIDSVLDVVRKEAENCDCLQGFQVCH
Sbjct: 87 PDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELIDSVLDVVRKEAENCDCLQGFQVCHSLGGGTGSG 146
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>ref|XP_004970293.1| PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: tubulin beta-4 chain-like [Setaria
italica]
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[Glycine max]
Length = 449
Score = 761 bits (1964), Expect = 0.0
Identities = 373/395 (94%), Positives = 378/395 (95%)
Frame = +2
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>tpg|DAA57202.1| TPA: beta tubulin6 [Zea mays]
Length = 488
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>ref|XP_003554108.1| PREDICTED: tubulin beta-4 chain-like [Glycine max]
Length = 450
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Sbjct: 387 AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE 421
>ref|XP_003624927.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|355499942|gb|AES81145.1|
Tubulin beta chain [Medicago truncatula]
Length = 527
Score = 761 bits (1964), Expect = 0.0
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Frame = +2
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AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE
Sbjct: 465 AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE 499
>ref|XP_003624926.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|355499941|gb|AES81144.1|
Tubulin beta chain [Medicago truncatula]
Length = 449
Score = 761 bits (1964), Expect = 0.0
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>gb|EEC71666.1| hypothetical protein OsI_04129 [Oryza sativa Indica Group]
Length = 496
Score = 761 bits (1964), Expect = 0.0
Identities = 373/395 (94%), Positives = 377/395 (95%)
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Sbjct: 376 DEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFT 435
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Sbjct: 436 AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE 470
>ref|NP_001167651.1| uncharacterized protein LOC100381281 [Zea mays]
gi|194702760|gb|ACF85464.1| unknown [Zea mays]
gi|414880072|tpg|DAA57203.1| TPA: beta tubulin6 isoform 1
[Zea mays] gi|414880073|tpg|DAA57204.1| TPA: beta
tubulin6 isoform 2 [Zea mays]
Length = 496
Score = 761 bits (1964), Expect = 0.0
Identities = 373/395 (94%), Positives = 377/395 (95%)
Frame = +2
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PDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELIDSVLDVVRKEAENCDCLQGFQVCH
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LYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFF
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MVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAAD RHGRYLTASAMFRGKMSTKEV
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AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE
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>ref|XP_002270069.1| PREDICTED: tubulin beta-4 chain [Vitis vinifera]
Length = 446
Score = 761 bits (1964), Expect = 0.0
Identities = 373/395 (94%), Positives = 377/395 (95%)
Frame = +2
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EHGID +GRY G++DLQLERVNVYYNEASCGRFVPRAVLMDLEPGTMDSVRTGPYGQIFR
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AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE
Sbjct: 387 AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE 421
>emb|CAE52516.1| beta tubulin [Setaria viridis]
Length = 448
Score = 761 bits (1964), Expect = 0.0
Identities = 373/395 (94%), Positives = 377/395 (95%)
Frame = +2
Query: 2 EHGIDSSGRYRGDNDLQLERVNVYYNEASCGRFVPRAVLMDLEPGTMDSVRTGPYGQIFR 181
EHGID +GRY G++DLQLERVNVYYNEASCGRFVPRAVLMDLEPGTMDSVRTGPYGQIFR
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AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE
Sbjct: 387 AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE 421
>gb|EXC19132.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis]
Length = 447
Score = 760 bits (1963), Expect = 0.0
Identities = 372/395 (94%), Positives = 377/395 (95%)
Frame = +2
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EHGIDS+GRY+GDN+LQLERVNVYYNEASCGRFVPRAVLMDLEPGTMDSVR+GPYGQIFR
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ISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEA
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LYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFF
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MVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAAD RHGRYLTASAMFRGKMSTKEV
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DEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKS+VCDI P GL MASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFT
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AMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE
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