BLASTX nr result
ID: Acanthopanax24_contig00003148
seq
BLASTX 2.2.26 [Sep-21-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Acanthopanax24_contig00003148
(685 letters)
Database: All non-redundant GenBank CDS
translations+PDB+SwissProt+PIR+PRF excluding environmental samples
from WGS projects
149,584,005 sequences; 54,822,741,787 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
ref|XP_015873189.1| PREDICTED: tubulin beta-4 chain-like, partia... 432 e-153
gb|ONM37143.1| beta tubulin6b [Zea mays] 432 e-152
gb|AEG89523.1| tubulin beta-6, partial [Brassica oleracea var. i... 429 e-151
gb|AQK99861.1| beta tubulin6 [Zea mays] 432 e-151
ref|XP_006369648.1| hypothetical protein POPTR_0001s27950g [Popu... 429 e-151
gb|PNT19997.1| hypothetical protein POPTR_009G067200v3 [Populus ... 431 e-151
ref|XP_017258541.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Daucus caro... 436 e-151
ref|NP_001140291.1| uncharacterized protein LOC100272336 [Zea ma... 432 e-150
gb|ACF88196.1| unknown [Zea mays] 432 e-150
gb|EEE55549.1| hypothetical protein OsJ_03802 [Oryza sativa Japo... 432 e-150
emb|CAA10664.1| beta-tubulin 2, partial [Hordeum vulgare subsp. ... 430 e-150
dbj|BAN42598.1| putative beta-tubulin, partial [Pyrus pyrifolia ... 426 e-150
gb|PIA30180.1| hypothetical protein AQUCO_05700111v1 [Aquilegia ... 430 e-150
gb|AJA29691.1| beta-tubulin [Betula luminifera] 431 e-150
gb|EEF39167.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis] 432 e-150
ref|XP_021745868.1| tubulin beta-6 chain [Chenopodium quinoa] >g... 434 e-150
ref|XP_021744674.1| tubulin beta-6 chain-like isoform X2 [Chenop... 434 e-150
ref|XP_021836150.1| tubulin beta-6 chain [Spinacia oleracea] >gi... 434 e-150
ref|XP_021829972.1| tubulin beta-5 chain [Prunus avium] 434 e-150
ref|XP_020086588.1| tubulin beta-1 chain [Ananas comosus] 434 e-150
>ref|XP_015873189.1| PREDICTED: tubulin beta-4 chain-like, partial [Ziziphus jujuba]
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>gb|ONM37143.1| beta tubulin6b [Zea mays]
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>gb|AEG89523.1| tubulin beta-6, partial [Brassica oleracea var. italica]
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>ref|XP_006369648.1| hypothetical protein POPTR_0001s27950g [Populus trichocarpa]
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ref|XP_017258543.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Daucus carota subsp. sativus]
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>ref|NP_001140291.1| uncharacterized protein LOC100272336 [Zea mays]
gb|ACN28163.1| unknown [Zea mays]
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>gb|ACF88196.1| unknown [Zea mays]
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Score = 432 bits (1112), Expect = e-150
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>gb|EEE55549.1| hypothetical protein OsJ_03802 [Oryza sativa Japonica Group]
Length = 382
Score = 432 bits (1112), Expect = e-150
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Sbjct: 273 SSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHW 332
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Sbjct: 333 YTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA 365
>emb|CAA10664.1| beta-tubulin 2, partial [Hordeum vulgare subsp. vulgare]
Length = 330
Score = 430 bits (1106), Expect = e-150
Identities = 210/213 (98%), Positives = 211/213 (99%)
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Sbjct: 101 TTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRG 160
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Sbjct: 161 SQMYRSLTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKN 220
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Sbjct: 221 SSYFVEWIPNNVKSSVCDIAPRGLSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHW 280
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Sbjct: 281 YTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEYQQYQDATA 313
>dbj|BAN42598.1| putative beta-tubulin, partial [Pyrus pyrifolia var. culta]
Length = 232
Score = 426 bits (1096), Expect = e-150
Identities = 206/213 (96%), Positives = 210/213 (98%)
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Sbjct: 124 SSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHW 183
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Sbjct: 184 YTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA 216
>gb|PIA30180.1| hypothetical protein AQUCO_05700111v1 [Aquilegia coerulea]
Length = 340
Score = 430 bits (1106), Expect = e-150
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+TP+FGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRG
Sbjct: 111 STPTFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRG 170
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Sbjct: 171 SQQYRSLTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKN 230
Query: 363 SSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHW 542
SSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGL+M+STFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHW
Sbjct: 231 SSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLTMSSTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHW 290
Query: 543 YTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEYQQYQDATA 641
YTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEYQQYQDATA
Sbjct: 291 YTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVAEYQQYQDATA 323
>gb|AJA29691.1| beta-tubulin [Betula luminifera]
Length = 382
Score = 431 bits (1109), Expect = e-150
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ref|XP_021745869.1| tubulin beta-6 chain [Chenopodium quinoa]
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Identities = 211/213 (99%), Positives = 212/213 (99%)
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>ref|XP_021744674.1| tubulin beta-6 chain-like isoform X2 [Chenopodium quinoa]
ref|XP_021744675.1| tubulin beta-6 chain-like isoform X2 [Chenopodium quinoa]
Length = 445
Score = 434 bits (1115), Expect = e-150
Identities = 211/213 (99%), Positives = 212/213 (99%)
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>ref|XP_021836150.1| tubulin beta-6 chain [Spinacia oleracea]
ref|XP_021836151.1| tubulin beta-6 chain [Spinacia oleracea]
gb|KNA16319.1| hypothetical protein SOVF_090230 [Spinacia oleracea]
Length = 445
Score = 434 bits (1115), Expect = e-150
Identities = 211/213 (99%), Positives = 212/213 (99%)
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>ref|XP_021829972.1| tubulin beta-5 chain [Prunus avium]
Length = 446
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Identities = 211/213 (99%), Positives = 212/213 (99%)
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>ref|XP_020086588.1| tubulin beta-1 chain [Ananas comosus]
Length = 446
Score = 434 bits (1115), Expect = e-150
Identities = 211/213 (99%), Positives = 212/213 (99%)
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