BLASTX nr result
ID: Acanthopanax23_contig00001614
seq
BLASTX 2.2.26 [Sep-21-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Acanthopanax23_contig00001614
(876 letters)
Database: All non-redundant GenBank CDS
translations+PDB+SwissProt+PIR+PRF excluding environmental samples
from WGS projects
149,584,005 sequences; 54,822,741,787 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
gb|ONM37143.1| beta tubulin6b [Zea mays] 455 e-159
gb|AEG89523.1| tubulin beta-6, partial [Brassica oleracea var. i... 452 e-159
gb|AQK99861.1| beta tubulin6 [Zea mays] 455 e-159
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gb|PNT19997.1| hypothetical protein POPTR_009G067200v3 [Populus ... 454 e-158
ref|NP_001140291.1| uncharacterized protein LOC100272336 [Zea ma... 455 e-158
gb|ACF88196.1| unknown [Zea mays] 455 e-158
gb|EEE55549.1| hypothetical protein OsJ_03802 [Oryza sativa Japo... 455 e-158
gb|AJA29691.1| beta-tubulin [Betula luminifera] 454 e-158
gb|EEF39167.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis] 455 e-158
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ref|XP_021744674.1| tubulin beta-6 chain-like isoform X2 [Chenop... 456 e-158
ref|XP_021836150.1| tubulin beta-6 chain [Spinacia oleracea] >gi... 456 e-158
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ref|XP_020086588.1| tubulin beta-1 chain [Ananas comosus] 456 e-158
gb|AIS84172.1| beta-tubulin 6a [Linum usitatissimum] 456 e-158
sp|P25862.1|TBB1_AVESA RecName: Full=Tubulin beta-1 chain; AltNa... 454 e-158
ref|XP_023877142.1| tubulin beta-4 chain [Quercus suber] 456 e-158
ref|XP_020101923.1| tubulin beta-1 chain-like [Ananas comosus] 456 e-158
ref|XP_009420971.1| PREDICTED: tubulin beta-4 chain [Musa acumin... 456 e-158
>gb|ONM37143.1| beta tubulin6b [Zea mays]
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>gb|AJA29691.1| beta-tubulin [Betula luminifera]
Length = 382
Score = 454 bits (1168), Expect = e-158
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>gb|EEF39167.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis]
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ref|XP_021745869.1| tubulin beta-6 chain [Chenopodium quinoa]
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ref|XP_021744675.1| tubulin beta-6 chain-like isoform X2 [Chenopodium quinoa]
Length = 445
Score = 456 bits (1174), Expect = e-158
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Sbjct: 388 MFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA 430
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ref|XP_021836151.1| tubulin beta-6 chain [Spinacia oleracea]
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Length = 445
Score = 456 bits (1174), Expect = e-158
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Sbjct: 208 YDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFM 267
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VGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVD
Sbjct: 268 VGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVD 327
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>ref|XP_020086588.1| tubulin beta-1 chain [Ananas comosus]
Length = 446
Score = 456 bits (1174), Expect = e-158
Identities = 222/223 (99%), Positives = 223/223 (100%)
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>gb|AIS84172.1| beta-tubulin 6a [Linum usitatissimum]
Length = 446
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Identities = 222/223 (99%), Positives = 223/223 (100%)
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emb|CAA38630.1| beta-tubulin, partial [Avena sativa]
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Identities = 221/223 (99%), Positives = 222/223 (99%)
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>ref|XP_023877142.1| tubulin beta-4 chain [Quercus suber]
Length = 447
Score = 456 bits (1174), Expect = e-158
Identities = 222/223 (99%), Positives = 223/223 (100%)
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>ref|XP_020101923.1| tubulin beta-1 chain-like [Ananas comosus]
Length = 447
Score = 456 bits (1174), Expect = e-158
Identities = 222/223 (99%), Positives = 223/223 (100%)
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>ref|XP_009420971.1| PREDICTED: tubulin beta-4 chain [Musa acuminata subsp. malaccensis]
Length = 448
Score = 456 bits (1174), Expect = e-158
Identities = 222/223 (99%), Positives = 223/223 (100%)
Frame = +3
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VGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVD
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