BLASTX nr result
ID: Zingiber24_contig00005603
seq
BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= Zingiber24_contig00005603 (650 letters) Database: ./nr 37,332,560 sequences; 13,225,080,153 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value ref|XP_006424984.1| hypothetical protein CICLE_v10028436mg [Citr... 442 e-122 ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachy... 442 e-122 ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus commun... 442 e-122 gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis] 442 e-122 ref|XP_006353299.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like isoform... 442 e-122 ref|XP_006287738.1| hypothetical protein CARUB_v10000948mg [Caps... 442 e-122 ref|XP_004234396.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu... 442 e-122 ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|... 442 e-122 ref|NP_568959.1| tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thalia... 441 e-122 sp|Q8H7U1.1|TBB2_ORYSJ RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltNa... 441 e-122 ref|XP_006649228.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Oryza ... 441 e-122 ref|XP_006339000.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like [Solanu... 441 e-122 gb|AGN95064.1| putative tubulin beta-2-like protein [Physaria fe... 441 e-122 gb|EOY33858.1| Tubulin beta 8 [Theobroma cacao] 441 e-122 ref|XP_006291122.1| hypothetical protein CARUB_v10017235mg [Caps... 441 e-122 gb|EMT08428.1| Tubulin beta-1 chain [Aegilops tauschii] 441 e-122 ref|XP_004249594.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu... 441 e-122 ref|XP_004249588.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu... 441 e-122 ref|XP_004172348.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumi... 441 e-122 ref|XP_004147894.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumi... 441 e-122 >ref|XP_006424984.1| hypothetical protein CICLE_v10028436mg [Citrus clementina] gi|568870498|ref|XP_006488439.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Citrus sinensis] gi|557526918|gb|ESR38224.1| hypothetical protein CICLE_v10028436mg [Citrus clementina] Length = 448 Score = 442 bits (1138), Expect = e-122 Identities = 214/216 (99%), Positives = 215/216 (99%) Frame = -1 Query: 650 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 471 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA Sbjct: 195 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 254 Query: 470 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 291 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS Sbjct: 255 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 314 Query: 290 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMSSTFIGNSTSI 111 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM+STFIGNSTSI Sbjct: 315 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 374 Query: 110 QEMFHRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 3 QEMF RVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE Sbjct: 375 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 410 >ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachypodium distachyon] Length = 448 Score = 442 bits (1138), Expect = e-122 Identities = 214/216 (99%), Positives = 215/216 (99%) Frame = -1 Query: 650 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 471 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA Sbjct: 196 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 255 Query: 470 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 291 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS Sbjct: 256 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 315 Query: 290 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMSSTFIGNSTSI 111 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM+STFIGNSTSI Sbjct: 316 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 375 Query: 110 QEMFHRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 3 QEMF RVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE Sbjct: 376 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 411 >ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis] gi|223540293|gb|EEF41864.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis] Length = 545 Score = 442 bits (1138), Expect = e-122 Identities = 214/216 (99%), Positives = 215/216 (99%) Frame = -1 Query: 650 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 471 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA Sbjct: 292 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 351 Query: 470 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 291 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS Sbjct: 352 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 411 Query: 290 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMSSTFIGNSTSI 111 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM+STFIGNSTSI Sbjct: 412 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 471 Query: 110 QEMFHRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 3 QEMF RVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE Sbjct: 472 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 507 >gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis] Length = 447 Score 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protein CARUB_v10000948mg [Capsella rubella] gi|482556444|gb|EOA20636.1| hypothetical protein CARUB_v10000948mg [Capsella rubella] Length = 449 Score = 442 bits (1136), Expect = e-122 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%) Frame = -1 Query: 650 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 471 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA Sbjct: 195 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 254 Query: 470 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 291 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS Sbjct: 255 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 314 Query: 290 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMSSTFIGNSTSI 111 AMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM+STFIGNSTSI Sbjct: 315 AMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 374 Query: 110 QEMFHRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 3 QEMF RVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE Sbjct: 375 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chain [Arabidopsis thaliana] gi|22136214|gb|AAM91185.1| tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana] gi|26449951|dbj|BAC42096.1| putative tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana] gi|27311963|gb|AAO00947.1| tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana] gi|332010260|gb|AED97643.1| tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana] gi|332010261|gb|AED97644.1| tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana] Length = 450 Score = 441 bits (1135), Expect = e-122 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%) Frame = -1 Query: 650 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 471 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA Sbjct: 195 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 254 Query: 470 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 291 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYR+LTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS Sbjct: 255 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRSLTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 314 Query: 290 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Positives = 215/216 (99%) Frame = -1 Query: 650 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 471 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA Sbjct: 195 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 254 Query: 470 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 291 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWD+KNMMCAADPRHGRYLTAS Sbjct: 255 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTAS 314 Query: 290 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMSSTFIGNSTSI 111 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM+STFIGNSTSI Sbjct: 315 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 374 Query: 110 QEMFHRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 3 QEMF RVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE Sbjct: 375 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 410 >ref|XP_004249588.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum] Length = 448 Score = 441 bits (1135), Expect = e-122 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 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