BLASTX nr result

ID: Zingiber24_contig00005603 seq

BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Zingiber24_contig00005603
         (650 letters)

Database: ./nr 
           37,332,560 sequences; 13,225,080,153 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

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ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachy...   442   e-122
ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus commun...   442   e-122
gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis]                      442   e-122
ref|XP_006353299.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like isoform...   442   e-122
ref|XP_006287738.1| hypothetical protein CARUB_v10000948mg [Caps...   442   e-122
ref|XP_004234396.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu...   442   e-122
ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|...   442   e-122
ref|NP_568959.1| tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thalia...   441   e-122
sp|Q8H7U1.1|TBB2_ORYSJ RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltNa...   441   e-122
ref|XP_006649228.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Oryza ...   441   e-122
ref|XP_006339000.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like [Solanu...   441   e-122
gb|AGN95064.1| putative tubulin beta-2-like protein [Physaria fe...   441   e-122
gb|EOY33858.1| Tubulin beta 8 [Theobroma cacao]                       441   e-122
ref|XP_006291122.1| hypothetical protein CARUB_v10017235mg [Caps...   441   e-122
gb|EMT08428.1| Tubulin beta-1 chain [Aegilops tauschii]               441   e-122
ref|XP_004249594.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu...   441   e-122
ref|XP_004249588.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu...   441   e-122
ref|XP_004172348.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumi...   441   e-122
ref|XP_004147894.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumi...   441   e-122

>ref|XP_006424984.1| hypothetical protein CICLE_v10028436mg [Citrus clementina]
           gi|568870498|ref|XP_006488439.1| PREDICTED: tubulin
           beta-2 chain-like [Citrus sinensis]
           gi|557526918|gb|ESR38224.1| hypothetical protein
           CICLE_v10028436mg [Citrus clementina]
          Length = 448

 Score =  442 bits (1138), Expect = e-122
 Identities = 214/216 (99%), Positives = 215/216 (99%)
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>ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachypodium distachyon]
          Length = 448

 Score =  442 bits (1138), Expect = e-122
 Identities = 214/216 (99%), Positives = 215/216 (99%)
 Frame = -1

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>ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis]
           gi|223540293|gb|EEF41864.1| tubulin beta chain, putative
           [Ricinus communis]
          Length = 545

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 Identities = 214/216 (99%), Positives = 215/216 (99%)
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>gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis]
          Length = 447

 Score =  442 bits (1138), Expect = e-122
 Identities = 214/216 (99%), Positives = 215/216 (99%)
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Sbjct: 375 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 410


>ref|XP_006353299.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like isoform X1 [Solanum tuberosum]
           gi|565373479|ref|XP_006353300.1| PREDICTED: tubulin
           beta-1 chain-like isoform X2 [Solanum tuberosum]
          Length = 447

 Score =  442 bits (1136), Expect = e-122
 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%)
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Sbjct: 375 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 410


>ref|XP_006287738.1| hypothetical protein CARUB_v10000948mg [Capsella rubella]
           gi|482556444|gb|EOA20636.1| hypothetical protein
           CARUB_v10000948mg [Capsella rubella]
          Length = 449

 Score =  442 bits (1136), Expect = e-122
 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%)
 Frame = -1

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Sbjct: 375 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 410


>ref|XP_004234396.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum]
          Length = 445

 Score =  442 bits (1136), Expect = e-122
 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%)
 Frame = -1

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           VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS
Sbjct: 255 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 314

Query: 290 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMSSTFIGNSTSI 111
           AMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM+STFIGNSTSI
Sbjct: 315 AMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 374

Query: 110 QEMFHRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 3
           QEMF RVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE
Sbjct: 375 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 410


>ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula]
           gi|355481332|gb|AES62535.1| Tubulin beta chain [Medicago
           truncatula]
          Length = 449

 Score =  442 bits (1136), Expect = e-122
 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%)
 Frame = -1

Query: 650 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 471
           NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA
Sbjct: 195 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 254

Query: 470 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 291
           VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS
Sbjct: 255 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 314

Query: 290 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMSSTFIGNSTSI 111
           AMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM+STFIGNSTSI
Sbjct: 315 AMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 374

Query: 110 QEMFHRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 3
           QEMF RVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE
Sbjct: 375 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 410


>ref|NP_568959.1| tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|18424622|ref|NP_568960.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
           [Arabidopsis thaliana]
           gi|408407919|sp|Q56YW9.2|TBB2_ARATH RecName:
           Full=Tubulin beta-2 chain
           gi|408407920|sp|Q9ASR0.2|TBB3_ARATH RecName:
           Full=Tubulin beta-3 chain gi|166898|gb|AAA32881.1|
           beta-2 tubulin [Arabidopsis thaliana]
           gi|166900|gb|AAA32882.1| beta-3 tubulin [Arabidopsis
           thaliana] gi|8809665|dbj|BAA97216.1| tubulin
           beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|10177447|dbj|BAB10838.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
           [Arabidopsis thaliana] gi|15912267|gb|AAL08267.1|
           AT5g62690/MRG21_11 [Arabidopsis thaliana]
           gi|16974570|gb|AAL31181.1| AT5g62700/MRG21_12
           [Arabidopsis thaliana] gi|17065076|gb|AAL32692.1|
           tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|17065332|gb|AAL32820.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
           [Arabidopsis thaliana] gi|21593444|gb|AAM65411.1|
           tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|22136214|gb|AAM91185.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
           [Arabidopsis thaliana] gi|26449951|dbj|BAC42096.1|
           putative tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis
           thaliana] gi|27311963|gb|AAO00947.1| tubulin
           beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|332010260|gb|AED97643.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
           [Arabidopsis thaliana] gi|332010261|gb|AED97644.1|
           tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
          Length = 450

 Score =  441 bits (1135), Expect = e-122
 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%)
 Frame = -1

Query: 650 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 471
           NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA
Sbjct: 195 NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA 254

Query: 470 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 291
           VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYR+LTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS
Sbjct: 255 VNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRSLTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTAS 314

Query: 290 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMSSTFIGNSTSI 111
           AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKM+STFIGNSTSI
Sbjct: 315 AMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSI 374

Query: 110 QEMFHRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 3
           QEMF RVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE
Sbjct: 375 QEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTE 410


>sp|Q8H7U1.1|TBB2_ORYSJ RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltName: Full=Beta-2-tubulin
           gi|24418032|gb|AAN60482.1| Putative beta tubulin [Oryza
           sativa Japonica Group] gi|108705732|gb|ABF93527.1|
           Tubulin beta-2 chain, putative, expressed [Oryza sativa
           Japonica Group] gi|215769447|dbj|BAH01676.1| unnamed
           protein product [Oryza sativa Japonica Group]
          Length = 447

 Score =  441 bits (1135), Expect = e-122
 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%)
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>ref|XP_006649228.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Oryza brachyantha]
          Length = 447

 Score =  441 bits (1135), Expect = e-122
 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%)
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>ref|XP_006339000.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like [Solanum tuberosum]
          Length = 447

 Score =  441 bits (1135), Expect = e-122
 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%)
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>gb|AGN95064.1| putative tubulin beta-2-like protein [Physaria fendleri]
          Length = 450

 Score =  441 bits (1135), Expect = e-122
 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%)
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>gb|EOY33858.1| Tubulin beta 8 [Theobroma cacao]
          Length = 444

 Score =  441 bits (1135), Expect = e-122
 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%)
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>ref|XP_006291122.1| hypothetical protein CARUB_v10017235mg [Capsella rubella]
           gi|565469890|ref|XP_006292748.1| hypothetical protein
           CARUB_v10018995mg [Capsella rubella]
           gi|482559829|gb|EOA24020.1| hypothetical protein
           CARUB_v10017235mg [Capsella rubella]
           gi|482561455|gb|EOA25646.1| hypothetical protein
           CARUB_v10018995mg [Capsella rubella]
          Length = 451

 Score =  441 bits (1135), Expect = e-122
 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%)
 Frame = -1

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>gb|EMT08428.1| Tubulin beta-1 chain [Aegilops tauschii]
          Length = 448

 Score =  441 bits (1135), Expect = e-122
 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%)
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>ref|XP_004249594.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum]
          Length = 446

 Score =  441 bits (1135), Expect = e-122
 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%)
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>ref|XP_004249588.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum]
          Length = 448

 Score =  441 bits (1135), Expect = e-122
 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%)
 Frame = -1

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>ref|XP_004172348.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumis sativus]
          Length = 446

 Score =  441 bits (1135), Expect = e-122
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>ref|XP_004147894.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumis sativus]
          Length = 446

 Score =  441 bits (1135), Expect = e-122
 Identities = 213/216 (98%), Positives = 215/216 (99%)
 Frame = -1

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           NADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLA
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