BLASTX nr result
ID: Rehmannia32_contig00002847
seq
BLASTX 2.2.26 [Sep-21-2011] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= Rehmannia32_contig00002847 (556 letters) Database: All non-redundant GenBank CDS translations+PDB+SwissProt+PIR+PRF excluding environmental samples from WGS projects 149,584,005 sequences; 54,822,741,787 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value dbj|BAN19963.1| tubulin, partial [Echinochloa phyllopogon] >gi|6... 376 e-130 gb|ONM37143.1| beta tubulin6b [Zea mays] 376 e-130 gb|AEG89523.1| tubulin beta-6, partial [Brassica oleracea var. i... 374 e-130 ref|XP_015873189.1| PREDICTED: tubulin beta-4 chain-like, partia... 372 e-130 gb|ACE00230.1| beta-tubulin, partial [Citrus maxima] 370 e-129 gb|AQK99861.1| beta tubulin6 [Zea mays] 375 e-129 ref|XP_006369648.1| hypothetical protein POPTR_0001s27950g [Popu... 373 e-129 ref|XP_020518509.1| tubulin beta-5 chain [Amborella trichopoda] ... 377 e-129 gb|PNT19997.1| hypothetical protein POPTR_009G067200v3 [Populus ... 375 e-129 ref|NP_001140291.1| uncharacterized protein LOC100272336 [Zea ma... 376 e-129 gb|ACF88196.1| unknown [Zea mays] 376 e-129 gb|EEE55549.1| hypothetical protein OsJ_03802 [Oryza sativa Japo... 376 e-129 ref|XP_021745868.1| tubulin beta-6 chain [Chenopodium quinoa] >g... 377 e-128 ref|XP_021744674.1| tubulin beta-6 chain-like isoform X2 [Chenop... 377 e-128 ref|XP_021836150.1| tubulin beta-6 chain [Spinacia oleracea] >gi... 377 e-128 gb|AJA29691.1| beta-tubulin [Betula luminifera] 375 e-128 ref|XP_021829972.1| tubulin beta-5 chain [Prunus avium] 377 e-128 ref|XP_020086588.1| tubulin beta-1 chain [Ananas comosus] 377 e-128 gb|AIS84172.1| beta-tubulin 6a [Linum usitatissimum] 377 e-128 gb|EEF39167.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis] 376 e-128 >dbj|BAN19963.1| tubulin, partial [Echinochloa phyllopogon] dbj|BAO73920.1| tubulin, partial [Echinochloa phyllopogon] Length = 264 Score = 376 bits (965), Expect = e-130 Identities = 183/184 (99%), Positives = 184/184 (100%) Frame = +3 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QNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFVGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKA 289 Query: 543 FLHW 554 FLHW Sbjct: 290 FLHW 293 >ref|XP_006369648.1| hypothetical protein POPTR_0001s27950g [Populus trichocarpa] Length = 285 Score = 373 bits (957), Expect = e-129 Identities = 182/184 (98%), Positives = 183/184 (99%) Frame = +3 Query: 3 TLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPL 182 TLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPL Sbjct: 52 TLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPL 111 Query: 183 TSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINV 362 TSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINV Sbjct: 112 TSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINV 171 Query: 363 QNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKA 542 QNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPP GL+MASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKA Sbjct: 172 QNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPIGLAMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKA 231 Query: 543 FLHW 554 FLHW Sbjct: 232 FLHW 235 >ref|XP_020518509.1| tubulin beta-5 chain [Amborella trichopoda] gb|ERM99111.1| hypothetical protein AMTR_s00101p00135960 [Amborella trichopoda] Length = 398 Score = 377 bits (968), Expect = e-129 Identities = 184/184 (100%), Positives = 184/184 (100%) Frame = +3 Query: 3 TLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPL 182 TLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPL Sbjct: 214 TLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPL 273 Query: 183 TSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINV 362 TSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINV Sbjct: 274 TSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINV 333 Query: 363 QNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKA 542 QNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKA Sbjct: 334 QNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKA 393 Query: 543 FLHW 554 FLHW Sbjct: 394 FLHW 397 >gb|PNT19997.1| hypothetical protein POPTR_009G067200v3 [Populus trichocarpa] Length = 337 Score = 375 bits (962), Expect = e-129 Identities = 182/184 (98%), Positives = 184/184 (100%) Frame = +3 Query: 3 TLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPL 182 TLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPL Sbjct: 105 TLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPL 164 Query: 183 TSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINV 362 TSRGSQQYRALTVPELTQQMWD+KNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINV Sbjct: 165 TSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINV 224 Query: 363 QNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKA 542 QNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGL+MASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKA Sbjct: 225 QNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLAMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKA 284 Query: 543 FLHW 554 FLHW Sbjct: 285 FLHW 288 >ref|NP_001140291.1| uncharacterized protein LOC100272336 [Zea mays] gb|ACN28163.1| unknown [Zea mays] Length = 379 Score = 376 bits (965), Expect = e-129 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