BLASTX 2.2.26 [Sep-21-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Rehmannia30_contig00000575
         (1037 letters)

Database: All non-redundant GenBank CDS
translations+PDB+SwissProt+PIR+PRF excluding environmental samples
from WGS projects 
           149,584,005 sequences; 54,822,741,787 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gb|ONM37143.1| beta tubulin6b [Zea mays]                              442   e-153
ref|XP_015873189.1| PREDICTED: tubulin beta-4 chain-like, partia...   439   e-153
gb|AEG89523.1| tubulin beta-6, partial [Brassica oleracea var. i...   439   e-153
gb|AQK99861.1| beta tubulin6 [Zea mays]                               442   e-152
ref|XP_006369648.1| hypothetical protein POPTR_0001s27950g [Popu...   439   e-152
gb|PNT19997.1| hypothetical protein POPTR_009G067200v3 [Populus ...   441   e-152
ref|NP_001140291.1| uncharacterized protein LOC100272336 [Zea ma...   442   e-152
gb|ACF88196.1| unknown [Zea mays]                                     442   e-152
gb|EEE55549.1| hypothetical protein OsJ_03802 [Oryza sativa Japo...   442   e-152
gb|AJA29691.1| beta-tubulin [Betula luminifera]                       441   e-152
gb|EEF39167.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis]        442   e-152
ref|XP_021745868.1| tubulin beta-6 chain [Chenopodium quinoa] >g...   443   e-152
ref|XP_021744674.1| tubulin beta-6 chain-like isoform X2 [Chenop...   443   e-152
ref|XP_021836150.1| tubulin beta-6 chain [Spinacia oleracea] >gi...   443   e-152
ref|XP_021829972.1| tubulin beta-5 chain [Prunus avium]               443   e-152
ref|XP_020086588.1| tubulin beta-1 chain [Ananas comosus]             443   e-152
gb|AIS84172.1| beta-tubulin 6a [Linum usitatissimum]                  443   e-152
ref|XP_023877142.1| tubulin beta-4 chain [Quercus suber]              443   e-152
ref|XP_020101923.1| tubulin beta-1 chain-like [Ananas comosus]        443   e-152
sp|P25862.1|TBB1_AVESA RecName: Full=Tubulin beta-1 chain; AltNa...   441   e-152

>gb|ONM37143.1| beta tubulin6b [Zea mays]
          Length = 300

 Score =  442 bits (1137), Expect = e-153
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>ref|XP_015873189.1| PREDICTED: tubulin beta-4 chain-like, partial [Ziziphus jujuba]
          Length = 231

 Score =  439 bits (1128), Expect = e-153
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>gb|AEG89523.1| tubulin beta-6, partial [Brassica oleracea var. italica]
          Length = 253

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>gb|AQK99861.1| beta tubulin6 [Zea mays]
          Length = 344

 Score =  442 bits (1136), Expect = e-152
 Identities = 215/217 (99%), Positives = 217/217 (100%)
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>ref|XP_006369648.1| hypothetical protein POPTR_0001s27950g [Populus trichocarpa]
          Length = 285

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 Identities = 215/217 (99%), Positives = 216/217 (99%)
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>gb|PNT19997.1| hypothetical protein POPTR_009G067200v3 [Populus trichocarpa]
          Length = 337

 Score =  441 bits (1134), Expect = e-152
 Identities = 215/217 (99%), Positives = 217/217 (100%)
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>ref|NP_001140291.1| uncharacterized protein LOC100272336 [Zea mays]
 gb|ACN28163.1| unknown [Zea mays]
          Length = 379

 Score =  442 bits (1137), Expect = e-152
 Identities = 216/217 (99%), Positives = 217/217 (100%)
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>gb|ACF88196.1| unknown [Zea mays]
          Length = 381

 Score =  442 bits (1137), Expect = e-152
 Identities = 216/217 (99%), Positives = 217/217 (100%)
 Frame = -3

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>gb|EEE55549.1| hypothetical protein OsJ_03802 [Oryza sativa Japonica Group]
          Length = 382

 Score =  442 bits (1137), Expect = e-152
 Identities = 216/217 (99%), Positives = 217/217 (100%)
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>gb|AJA29691.1| beta-tubulin [Betula luminifera]
          Length = 382

 Score =  441 bits (1134), Expect = e-152
 Identities = 215/217 (99%), Positives = 217/217 (100%)
 Frame = -3

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Sbjct: 329  FLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA 365


>gb|EEF39167.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis]
          Length = 414

 Score =  442 bits (1137), Expect = e-152
 Identities = 216/217 (99%), Positives = 217/217 (100%)
 Frame = -3

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Sbjct: 182  TLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPL 241

Query: 855  TSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINV 676
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Sbjct: 242  TSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINV 301

Query: 675  QNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKA 496
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Sbjct: 302  QNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKA 361

Query: 495  FLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA 385
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Sbjct: 362  FLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA 398


>ref|XP_021745868.1| tubulin beta-6 chain [Chenopodium quinoa]
 ref|XP_021745869.1| tubulin beta-6 chain [Chenopodium quinoa]
          Length = 445

 Score =  443 bits (1140), Expect = e-152
 Identities = 217/217 (100%), Positives = 217/217 (100%)
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>ref|XP_021744674.1| tubulin beta-6 chain-like isoform X2 [Chenopodium quinoa]
 ref|XP_021744675.1| tubulin beta-6 chain-like isoform X2 [Chenopodium quinoa]
          Length = 445

 Score =  443 bits (1140), Expect = e-152
 Identities = 217/217 (100%), Positives = 217/217 (100%)
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>ref|XP_021836150.1| tubulin beta-6 chain [Spinacia oleracea]
 ref|XP_021836151.1| tubulin beta-6 chain [Spinacia oleracea]
 gb|KNA16319.1| hypothetical protein SOVF_090230 [Spinacia oleracea]
          Length = 445

 Score =  443 bits (1140), Expect = e-152
 Identities = 217/217 (100%), Positives = 217/217 (100%)
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>ref|XP_021829972.1| tubulin beta-5 chain [Prunus avium]
          Length = 446

 Score =  443 bits (1140), Expect = e-152
 Identities = 217/217 (100%), Positives = 217/217 (100%)
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>ref|XP_020086588.1| tubulin beta-1 chain [Ananas comosus]
          Length = 446

 Score =  443 bits (1140), Expect = e-152
 Identities = 217/217 (100%), Positives = 217/217 (100%)
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>gb|AIS84172.1| beta-tubulin 6a [Linum usitatissimum]
          Length = 446

 Score =  443 bits (1140), Expect = e-152
 Identities = 217/217 (100%), Positives = 217/217 (100%)
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>ref|XP_023877142.1| tubulin beta-4 chain [Quercus suber]
          Length = 447

 Score =  443 bits (1140), Expect = e-152
 Identities = 217/217 (100%), Positives = 217/217 (100%)
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>ref|XP_020101923.1| tubulin beta-1 chain-like [Ananas comosus]
          Length = 447

 Score =  443 bits (1140), Expect = e-152
 Identities = 217/217 (100%), Positives = 217/217 (100%)
 Frame = -3

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Sbjct: 394  FLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA 430


>sp|P25862.1|TBB1_AVESA RecName: Full=Tubulin beta-1 chain; AltName: Full=Beta-1-tubulin
 emb|CAA38630.1| beta-tubulin, partial [Avena sativa]
          Length = 386

 Score =  441 bits (1134), Expect = e-152
 Identities = 216/217 (99%), Positives = 216/217 (99%)
 Frame = -3

Query: 1035 TLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPL 856
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Query: 855  TSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINV 676
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Sbjct: 212  TSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINV 271

Query: 675  QNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPRGLSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKA 496
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Sbjct: 272  QNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLSMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKA 331

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Sbjct: 332  FLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA 368