BLASTX nr result
ID: Rehmannia26_contig00003940
seq
BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= Rehmannia26_contig00003940 (753 letters) Database: ./nr 37,332,560 sequences; 13,225,080,153 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value gb|EPS63165.1| tubulin, beta chain, partial [Genlisea aurea] 457 e-126 ref|XP_002509801.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus commun... 457 e-126 gb|AGJ50594.1| beta-tubulin [Pericallis cruenta] 456 e-126 gb|AGH08228.1| beta-tubulin 10 [Salix arbutifolia] 455 e-126 ref|XP_002304492.1| hypothetical protein POPTR_0003s12690g [Popu... 455 e-126 gb|EOY24725.1| Beta-6 tubulin [Theobroma cacao] 454 e-125 gb|EXB37356.1| Tubulin beta-1 chain [Morus notabilis] 454 e-125 ref|XP_004159949.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumi... 453 e-125 ref|XP_004143909.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Cucumi... 453 e-125 ref|XP_002273514.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Vitis vinif... 453 e-125 dbj|BAN58313.1| beta tubulin [Chrysanthemum x morifolium] 452 e-125 ref|XP_003532738.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Glycin... 451 e-124 gb|AAN32988.1| beta-tubulin 1 [Gossypium hirsutum] 451 e-124 ref|XP_006827659.1| hypothetical protein AMTR_s00009p00251790 [A... 451 e-124 gb|EMT00232.1| Tubulin beta-2 chain [Aegilops tauschii] 451 e-124 sp|P93176.1|TBB_HORVU RecName: Full=Tubulin beta chain; AltName:... 451 e-124 gb|ABS50665.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis] gi|383081782|db... 449 e-124 ref|XP_006476582.1| PREDICTED: tubulin beta-3 chain-like [Citrus... 449 e-124 ref|XP_006439557.1| hypothetical protein CICLE_v10020164mg [Citr... 449 e-124 sp|P25862.1|TBB1_AVESA RecName: Full=Tubulin beta-1 chain; AltNa... 449 e-124 >gb|EPS63165.1| tubulin, beta chain, partial [Genlisea aurea] Length = 440 Score = 457 bits (1175), Expect = e-126 Identities = 221/224 (98%), Positives = 224/224 (100%) Frame = +1 Query: 1 LYDICFRTLKLTNPSFGDLNHLISTTMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFF 180 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(1159), Expect = e-124 Identities = 218/224 (97%), Positives = 222/224 (99%) Frame = +1 Query: 1 LYDICFRTLKLTNPSFGDLNHLISTTMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFF 180 LYDICFRTLKLTNPSFGDLNHLISTTMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFF Sbjct: 207 LYDICFRTLKLTNPSFGDLNHLISTTMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFF 266 Query: 181 MVGFAPLTSRGSQQYRALTIPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEV 360 MVGFAPLTSRGSQ YRAL+IPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEV Sbjct: 267 MVGFAPLTSRGSQNYRALSIPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEV 326 Query: 361 DEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLSMSSTFVGNSTSIQEMFRRVSEQFT 540 DEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGL+MSSTF+GNSTSIQEMFRRVSEQFT Sbjct: 327 DEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLAMSSTFMGNSTSIQEMFRRVSEQFT 386 Query: 541 VMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDANA 672 VMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQ+A A Sbjct: 387 VMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQEATA 430 >gb|EMT00232.1| Tubulin beta-2 chain [Aegilops tauschii] Length = 466 Score = 451 bits (1159), Expect = e-124 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vulgare subsp. vulgare] gi|146760207|emb|CAM58979.1| beta tubulin 1 [Hordeum vulgare subsp. vulgare] gi|326510493|dbj|BAJ87463.1| predicted protein [Hordeum vulgare subsp. vulgare] gi|326516356|dbj|BAJ92333.1| predicted protein [Hordeum vulgare subsp. vulgare] gi|326528527|dbj|BAJ93445.1| predicted protein [Hordeum vulgare subsp. vulgare] Length = 447 Score = 451 bits (1159), Expect = e-124 Identities = 218/224 (97%), Positives = 220/224 (98%) Frame = +1 Query: 1 LYDICFRTLKLTNPSFGDLNHLISTTMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFF 180 LYDICFRTLKLT PSFGDLNHLIS TMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFF Sbjct: 207 LYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFF 266 Query: 181 MVGFAPLTSRGSQQYRALTIPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEV 360 MVGFAPLTSRGSQQYRALT+PELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEV Sbjct: 267 MVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEV 326 Query: 361 DEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLSMSSTFVGNSTSIQEMFRRVSEQFT 540 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DEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLSMSSTFVGNSTSIQEMFRRVSEQFT 540 DEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGL MSSTF+GNSTSIQEMFRRVSEQFT Sbjct: 327 DEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLRMSSTFMGNSTSIQEMFRRVSEQFT 386 Query: 541 VMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDANA 672 VMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDA A Sbjct: 387 VMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDAVA 430 >ref|XP_006476582.1| PREDICTED: tubulin beta-3 chain-like [Citrus sinensis] Length = 443 Score = 449 bits (1155), Expect = e-124 Identities = 217/224 (96%), Positives = 223/224 (99%) Frame = +1 Query: 1 LYDICFRTLKLTNPSFGDLNHLISTTMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFF 180 LYDICFRTLKLTNPSFGDLNHLISTTMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFF Sbjct: 207 LYDICFRTLKLTNPSFGDLNHLISTTMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFF 266 Query: 181 MVGFAPLTSRGSQQYRALTIPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEV 360 MVGFAPLT+RGSQQYRALTIPELTQQMWD+KNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEV Sbjct: 267 MVGFAPLTARGSQQYRALTIPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEV 326 Query: 361 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Sbjct: 267 MVGFAPLTARGSQQYRALTIPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEV 326 Query: 361 DEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLSMSSTFVGNSTSIQEMFRRVSEQFT 540 DEQMINVQNKNSSYFVEWIP+NVKSSVCDIPPTGLSMSSTF+GNSTSIQEMFRRVSEQFT Sbjct: 327 DEQMINVQNKNSSYFVEWIPHNVKSSVCDIPPTGLSMSSTFMGNSTSIQEMFRRVSEQFT 386 Query: 541 VMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDANA 672 VMF+RKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQ+A A Sbjct: 387 VMFKRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQEAAA 430 >sp|P25862.1|TBB1_AVESA RecName: Full=Tubulin beta-1 chain; AltName: Full=Beta-1-tubulin gi|16122|emb|CAA38630.1| beta-tubulin [Avena sativa] Length = 386 Score = 449 bits (1155), Expect = e-124 Identities = 216/224 (96%), Positives = 220/224 (98%) Frame = +1 Query: 1 LYDICFRTLKLTNPSFGDLNHLISTTMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFF 180 LYDICFRTLKLT PSFGDLNHLIS TMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFF Sbjct: 145 LYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHFF 204 Query: 181 MVGFAPLTSRGSQQYRALTIPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKEV 360 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