BLASTX nr result

ID: Papaver23_contig00000474 seq

BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Papaver23_contig00000474
         (481 letters)

Database: ./nr 
           23,641,837 sequences; 8,123,359,852 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachy...   326   1e-87
ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus commun...   326   1e-87
gb|ACI03399.1| beta-tubulin [Prunus salicina var. cordata]            326   1e-87
gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis]                      326   1e-87
ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|...   326   1e-87

>ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachypodium distachyon]
          Length = 448

 Score =  326 bits (836), Expect = 1e-87
 Identities = 157/159 (98%), Positives = 159/159 (100%)
 Frame = +3

Query: 3   LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAM 182
           LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRAL+VPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAM
Sbjct: 258 LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAM 317

Query: 183 FRGKMSTKEVDEQMMNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQE 362
           FRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQE
Sbjct: 318 FRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQE 377

Query: 363 MFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 479
           MFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM
Sbjct: 378 MFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 416


>ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis]
           gi|223540293|gb|EEF41864.1| tubulin beta chain, putative
           [Ricinus communis]
          Length = 545

 Score =  326 bits (836), Expect = 1e-87
 Identities = 157/159 (98%), Positives = 159/159 (100%)
 Frame = +3

Query: 3   LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAM 182
           LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRAL+VPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAM
Sbjct: 354 LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAM 413

Query: 183 FRGKMSTKEVDEQMMNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQE 362
           FRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQE
Sbjct: 414 FRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQE 473

Query: 363 MFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 479
           MFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM
Sbjct: 474 MFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 512


>gb|ACI03399.1| beta-tubulin [Prunus salicina var. cordata]
          Length = 446

 Score =  326 bits (836), Expect = 1e-87
 Identities = 157/159 (98%), Positives = 159/159 (100%)
 Frame = +3

Query: 3   LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAM 182
           LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRAL+VPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAM
Sbjct: 257 LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAM 316

Query: 183 FRGKMSTKEVDEQMMNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQE 362
           FRGKMSTKEVD+QMMNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQE
Sbjct: 317 FRGKMSTKEVDDQMMNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQE 376

Query: 363 MFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 479
           MFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM
Sbjct: 377 MFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 415


>gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis]
          Length = 447

 Score =  326 bits (836), Expect = 1e-87
 Identities = 157/159 (98%), Positives = 159/159 (100%)
 Frame = +3

Query: 3   LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAM 182
           LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRAL+VPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAM
Sbjct: 257 LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAM 316

Query: 183 FRGKMSTKEVDEQMMNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQE 362
           FRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQE
Sbjct: 317 FRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQE 376

Query: 363 MFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 479
           MFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM
Sbjct: 377 MFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 415


>ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula]
           gi|355481332|gb|AES62535.1| Tubulin beta chain [Medicago
           truncatula]
          Length = 449

 Score =  326 bits (835), Expect = 1e-87
 Identities = 157/159 (98%), Positives = 159/159 (100%)
 Frame = +3

Query: 3   LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALSVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAM 182
           LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRAL+VPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAM
Sbjct: 257 LIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDSKNMMCAADPRHGRYLTASAM 316

Query: 183 FRGKMSTKEVDEQMMNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQE 362
           FRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQE
Sbjct: 317 FRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQE 376

Query: 363 MFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 479
           MFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM
Sbjct: 377 MFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNM 415


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