BLASTX nr result
ID: Ophiopogon22_contig00014523
seq
BLASTX 2.2.26 [Sep-21-2011]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= Ophiopogon22_contig00014523
(793 letters)
Database: All non-redundant GenBank CDS
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from WGS projects
149,584,005 sequences; 54,822,741,787 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
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gb|KQK93065.1| hypothetical protein SETIT_039761mg, partial [Set... 288 e-129
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gb|EOA24020.1| hypothetical protein CARUB_v10017235mg [Capsella rubella]
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gb|AAM91185.1| tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
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gb|AAO00947.1| tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
gb|AED97643.1| tubulin beta chain 2 [Arabidopsis thaliana]
gb|AED97644.1| tubulin beta chain 3 [Arabidopsis thaliana]
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ref|XP_018440532.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain [Raphanus sativus]
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ref|XP_013629292.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain [Brassica oleracea var. oleracea]
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Sbjct: 381 VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE 421
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>ref|XP_006404432.1| tubulin beta-2 chain [Eutrema salsugineum]
ref|XP_006404433.1| tubulin beta-2 chain [Eutrema salsugineum]
dbj|BAJ33671.1| unnamed protein product [Eutrema halophilum]
gb|ESQ45885.1| hypothetical protein EUTSA_v10010368mg [Eutrema salsugineum]
gb|ESQ45886.1| hypothetical protein EUTSA_v10010369mg [Eutrema salsugineum]
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Score = 290 bits (741), Expect(2) = e-129
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>ref|XP_010503303.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Camelina sativa]
ref|XP_013706649.1| tubulin beta-2 chain-like [Brassica napus]
ref|XP_020880680.1| tubulin beta-2 chain [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata]
gb|EFH53778.1| tubulin beta-2 [Arabidopsis lyrata subsp. lyrata]
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>ref|XP_013711754.1| tubulin beta-2 chain-like isoform X2 [Brassica napus]
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>ref|XP_020247208.1| LOW QUALITY PROTEIN: tubulin beta-1 chain-like [Asparagus
officinalis]
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>ref|XP_013642908.1| tubulin beta-2 chain-like [Brassica napus]
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Sbjct: 270 FAPLTSRGSQQYRSLTVPELTQQ 292
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Sbjct: 321 MSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRR 380
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VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE
Sbjct: 381 VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE 421
>gb|EEF41864.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis]
Length = 545
Score = 288 bits (738), Expect(2) = e-129
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Score = 201 bits (512), Expect(2) = e-129
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VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE
Sbjct: 478 VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE 518
>ref|XP_015575482.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain [Ricinus communis]
Length = 521
Score = 288 bits (738), Expect(2) = e-129
Identities = 142/143 (99%), Positives = 143/143 (100%)
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Score = 201 bits (512), Expect(2) = e-129
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>gb|ESR35164.1| hypothetical protein CICLE_v10004755mg [Citrus clementina]
Length = 514
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Sbjct: 449 VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE 489
>gb|EEE58163.1| hypothetical protein OsJ_09084 [Oryza sativa Japonica Group]
Length = 480
Score = 288 bits (738), Expect(2) = e-129
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Sbjct: 303 FAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQ 325
Score = 201 bits (512), Expect(2) = e-129
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Sbjct: 354 MSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRR 413
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Sbjct: 414 VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE 454
>gb|KQK93065.1| hypothetical protein SETIT_039761mg, partial [Setaria italica]
Length = 455
Score = 288 bits (738), Expect(2) = e-129
Identities = 142/143 (99%), Positives = 143/143 (100%)
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Sbjct: 157 LLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECMVLDNEALYD 216
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Frame = -3
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Sbjct: 328 MSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRR 387
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Sbjct: 388 VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSE 428