BLASTX nr result

ID: Mentha22_contig00006316 seq

BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Mentha22_contig00006316
         (610 letters)

Database: ./nr 
           38,876,450 sequences; 13,856,398,315 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

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ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachy...   417   e-114
ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus commun...   417   e-114
gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis]                      417   e-114
gb|EYU19549.1| hypothetical protein MIMGU_mgv1a006353mg [Mimulus...   416   e-114
ref|XP_006353299.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like isoform...   416   e-114
ref|XP_006287738.1| hypothetical protein CARUB_v10000948mg [Caps...   416   e-114
ref|XP_004234396.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu...   416   e-114
ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula] gi|...   416   e-114
gb|EYU38453.1| hypothetical protein MIMGU_mgv1a006387mg [Mimulus...   416   e-114
gb|EYU38358.1| hypothetical protein MIMGU_mgv1a007077mg [Mimulus...   416   e-114
ref|NP_568959.1| tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thalia...   416   e-114
sp|Q8H7U1.1|TBB2_ORYSJ RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltNa...   416   e-114
ref|XP_006649228.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Oryza ...   416   e-114
ref|XP_006339000.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like [Solanu...   416   e-114
gb|AGN95064.1| putative tubulin beta-2-like protein [Physaria fe...   416   e-114
ref|XP_007016239.1| Tubulin beta 8 [Theobroma cacao] gi|50878660...   416   e-114
ref|XP_006291122.1| hypothetical protein CARUB_v10017235mg [Caps...   416   e-114
gb|EMT08428.1| Tubulin beta-1 chain [Aegilops tauschii]               416   e-114
ref|XP_004249594.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanu...   416   e-114

>ref|XP_006424984.1| hypothetical protein CICLE_v10028436mg [Citrus clementina]
           gi|568870498|ref|XP_006488439.1| PREDICTED: tubulin
           beta-2 chain-like [Citrus sinensis]
           gi|557526918|gb|ESR38224.1| hypothetical protein
           CICLE_v10028436mg [Citrus clementina]
          Length = 448

 Score =  417 bits (1072), Expect = e-114
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>ref|XP_003559023.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Brachypodium distachyon]
          Length = 448

 Score =  417 bits (1072), Expect = e-114
 Identities = 202/203 (99%), Positives = 203/203 (100%)
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>ref|XP_002520451.1| tubulin beta chain, putative [Ricinus communis]
           gi|223540293|gb|EEF41864.1| tubulin beta chain, putative
           [Ricinus communis]
          Length = 545

 Score =  417 bits (1072), Expect = e-114
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>gb|ABS50666.1| beta-tubulin [Eucalyptus grandis]
          Length = 447

 Score =  417 bits (1072), Expect = e-114
 Identities = 202/203 (99%), Positives = 203/203 (100%)
 Frame = -1

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>gb|EYU19549.1| hypothetical protein MIMGU_mgv1a006353mg [Mimulus guttatus]
          Length = 447

 Score =  416 bits (1070), Expect = e-114
 Identities = 201/203 (99%), Positives = 203/203 (100%)
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>ref|XP_006353299.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like isoform X1 [Solanum tuberosum]
           gi|565373479|ref|XP_006353300.1| PREDICTED: tubulin
           beta-1 chain-like isoform X2 [Solanum tuberosum]
          Length = 447

 Score =  416 bits (1070), Expect = e-114
 Identities = 201/203 (99%), Positives = 203/203 (100%)
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>ref|XP_006287738.1| hypothetical protein CARUB_v10000948mg [Capsella rubella]
           gi|482556444|gb|EOA20636.1| hypothetical protein
           CARUB_v10000948mg [Capsella rubella]
          Length = 449

 Score =  416 bits (1070), Expect = e-114
 Identities = 201/203 (99%), Positives = 203/203 (100%)
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Sbjct: 386 TAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEF 408


>ref|XP_004234396.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum]
          Length = 445

 Score =  416 bits (1070), Expect = e-114
 Identities = 201/203 (99%), Positives = 203/203 (100%)
 Frame = -1

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           TAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEF
Sbjct: 386 TAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEF 408


>ref|XP_003592284.1| Tubulin beta chain [Medicago truncatula]
           gi|355481332|gb|AES62535.1| Tubulin beta chain [Medicago
           truncatula]
          Length = 449

 Score =  416 bits (1070), Expect = e-114
 Identities = 201/203 (99%), Positives = 203/203 (100%)
 Frame = -1

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Query: 250 VDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQF 71
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>gb|EYU38453.1| hypothetical protein MIMGU_mgv1a006387mg [Mimulus guttatus]
          Length = 445

 Score =  416 bits (1069), Expect = e-114
 Identities = 201/203 (99%), Positives = 203/203 (100%)
 Frame = -1

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Sbjct: 386 TAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEF 408


>gb|EYU38358.1| hypothetical protein MIMGU_mgv1a007077mg [Mimulus guttatus]
          Length = 420

 Score =  416 bits (1069), Expect = e-114
 Identities = 200/203 (98%), Positives = 203/203 (100%)
 Frame = -1

Query: 610 ALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHF 431
           ALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHF
Sbjct: 206 ALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSDLRKLAVNLIPFPRLHF 265

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Sbjct: 266 FMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAVFRGKMSTKE 325

Query: 250 VDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRRVSEQF 71
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Sbjct: 326 VDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFVGNSTSIQEMFRRVSEQF 385

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           TAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEF
Sbjct: 386 TAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEF 408


>ref|NP_568959.1| tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|18424622|ref|NP_568960.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
           [Arabidopsis thaliana]
           gi|408407919|sp|Q56YW9.2|TBB2_ARATH RecName:
           Full=Tubulin beta-2 chain
           gi|408407920|sp|Q9ASR0.2|TBB3_ARATH RecName:
           Full=Tubulin beta-3 chain gi|166898|gb|AAA32881.1|
           beta-2 tubulin [Arabidopsis thaliana]
           gi|166900|gb|AAA32882.1| beta-3 tubulin [Arabidopsis
           thaliana] gi|8809665|dbj|BAA97216.1| tubulin
           beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|10177447|dbj|BAB10838.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
           [Arabidopsis thaliana] gi|15912267|gb|AAL08267.1|
           AT5g62690/MRG21_11 [Arabidopsis thaliana]
           gi|16974570|gb|AAL31181.1| AT5g62700/MRG21_12
           [Arabidopsis thaliana] gi|17065076|gb|AAL32692.1|
           tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|17065332|gb|AAL32820.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
           [Arabidopsis thaliana] gi|21593444|gb|AAM65411.1|
           tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|22136214|gb|AAM91185.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
           [Arabidopsis thaliana] gi|26449951|dbj|BAC42096.1|
           putative tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis
           thaliana] gi|27311963|gb|AAO00947.1| tubulin
           beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
           gi|332010260|gb|AED97643.1| tubulin beta-2/beta-3 chain
           [Arabidopsis thaliana] gi|332010261|gb|AED97644.1|
           tubulin beta-2/beta-3 chain [Arabidopsis thaliana]
          Length = 450

 Score =  416 bits (1069), Expect = e-114
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>sp|Q8H7U1.1|TBB2_ORYSJ RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltName: Full=Beta-2-tubulin
           gi|24418032|gb|AAN60482.1| Putative beta tubulin [Oryza
           sativa Japonica Group] gi|108705732|gb|ABF93527.1|
           Tubulin beta-2 chain, putative, expressed [Oryza sativa
           Japonica Group] gi|215769447|dbj|BAH01676.1| unnamed
           protein product [Oryza sativa Japonica Group]
          Length = 447

 Score =  416 bits (1069), Expect = e-114
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>ref|XP_006649228.1| PREDICTED: tubulin beta-2 chain-like [Oryza brachyantha]
          Length = 447

 Score =  416 bits (1069), Expect = e-114
 Identities = 201/203 (99%), Positives = 203/203 (100%)
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>ref|XP_006339000.1| PREDICTED: tubulin beta-8 chain-like [Solanum tuberosum]
          Length = 447

 Score =  416 bits (1069), Expect = e-114
 Identities = 201/203 (99%), Positives = 203/203 (100%)
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>gb|AGN95064.1| putative tubulin beta-2-like protein [Physaria fendleri]
          Length = 450

 Score =  416 bits (1069), Expect = e-114
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>ref|XP_007016239.1| Tubulin beta 8 [Theobroma cacao] gi|508786602|gb|EOY33858.1|
           Tubulin beta 8 [Theobroma cacao]
          Length = 444

 Score =  416 bits (1069), Expect = e-114
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>ref|XP_006291122.1| hypothetical protein CARUB_v10017235mg [Capsella rubella]
           gi|565469890|ref|XP_006292748.1| hypothetical protein
           CARUB_v10018995mg [Capsella rubella]
           gi|482559829|gb|EOA24020.1| hypothetical protein
           CARUB_v10017235mg [Capsella rubella]
           gi|482561455|gb|EOA25646.1| hypothetical protein
           CARUB_v10018995mg [Capsella rubella]
          Length = 451

 Score =  416 bits (1069), Expect = e-114
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>gb|EMT08428.1| Tubulin beta-1 chain [Aegilops tauschii]
          Length = 448

 Score =  416 bits (1069), Expect = e-114
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>ref|XP_004249594.1| PREDICTED: tubulin beta-1 chain-like [Solanum lycopersicum]
          Length = 446

 Score =  416 bits (1069), Expect = e-114
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Sbjct: 266 FMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGKMSTKE 325

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