BLASTX nr result

ID: Glycyrrhiza28_contig00037657 seq

BLASTX 2.2.26 [Sep-21-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Glycyrrhiza28_contig00037657
         (346 letters)

Database: ./nr 
           115,041,592 sequences; 42,171,959,267 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

KMY25486.1 transposase [Neisseria gonorrhoeae FA6140]                 211   2e-67
AKP12636.1 L1 transposable element [Neisseria gonorrhoeae] KMW65...   147   5e-43
AAC51272.1 p40 [Homo sapiens]                                         150   2e-42
AAC51275.1 p40 [Homo sapiens]                                         150   2e-42
AAC51268.1 p40 [Homo sapiens]                                         150   2e-42
AAC51270.1 p40 [Homo sapiens]                                         150   2e-42
AAB59367.1 ORF1 codes for a 40 kDa product [Homo sapiens]             150   2e-42
AAC51278.1 p40 [Homo sapiens]                                         150   2e-42
AAC51262.1 p40 [Homo sapiens]                                         150   2e-42
prf||1901303A Leu zipper protein p40                                  150   2e-42
AER41894.1 unknown [Homo sapiens]                                     150   2e-42
Q9UN81.1 RecName: Full=LINE-1 retrotransposable element ORF1 pro...   150   2e-42
AAB60344.1 ORF1 [Homo sapiens]                                        150   2e-42
ABE73455.1 RNA-binding protein [Pan troglodytes]                      149   6e-42
AAC51274.1 p40 [Homo sapiens]                                         149   8e-42
AAL50636.1 unknown [Homo sapiens]                                     149   8e-42
WP_077128851.1 hypothetical protein [Shigella sonnei]                 148   2e-41
CJS63992.1 L1 transposable element [Streptococcus pneumoniae] CN...   148   2e-41
AAC51266.1 p40 [Homo sapiens]                                         148   2e-41
AAC51277.1 p40 [Homo sapiens]                                         148   2e-41

>KMY25486.1 transposase [Neisseria gonorrhoeae FA6140]
          Length = 214

 Score =  211 bits (536), Expect = 2e-67
 Identities = 101/107 (94%), Positives = 104/107 (97%)
 Frame = +1

Query: 25  LLEGKLTNRKDIHTKNPSVHHHHQRPKVDKTTKMGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSS 204
           +LEGKLT RKDI+T+NPSVHHHHQRPKVDKTTKM KKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSS
Sbjct: 1   MLEGKLTTRKDIYTENPSVHHHHQRPKVDKTTKMRKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSS 60

Query: 205 PATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQTKGKEVENFEKNLE 345
           PATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQTKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  PATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQTKGKEVENFEKNLE 107


>AKP12636.1 L1 transposable element [Neisseria gonorrhoeae] KMW65647.1
           hypothetical protein NGCG_01774 [Neisseria gonorrhoeae
           DGI18] KMY05571.1 hypothetical protein NGIG_01774
           [Neisseria gonorrhoeae PID24-1] SBO49519.1 L1
           transposable element [Neisseria gonorrhoeae] SBM89190.1
           L1 transposable element [Neisseria gonorrhoeae]
           OOD37315.1 hypothetical protein BWP02_02745 [Neisseria
           gonorrhoeae]
          Length = 181

 Score =  147 bits (372), Expect = 5e-43
 Identities = 72/74 (97%), Positives = 72/74 (97%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           M KKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MRKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>AAC51272.1 p40 [Homo sapiens]
          Length = 338

 Score =  150 bits (380), Expect = 2e-42
 Identities = 73/74 (98%), Positives = 73/74 (98%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>AAC51275.1 p40 [Homo sapiens]
          Length = 338

 Score =  150 bits (380), Expect = 2e-42
 Identities = 73/74 (98%), Positives = 73/74 (98%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>AAC51268.1 p40 [Homo sapiens]
          Length = 338

 Score =  150 bits (380), Expect = 2e-42
 Identities = 73/74 (98%), Positives = 73/74 (98%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>AAC51270.1 p40 [Homo sapiens]
          Length = 338

 Score =  150 bits (380), Expect = 2e-42
 Identities = 73/74 (98%), Positives = 73/74 (98%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>AAB59367.1 ORF1 codes for a 40 kDa product [Homo sapiens]
          Length = 338

 Score =  150 bits (380), Expect = 2e-42
 Identities = 73/74 (98%), Positives = 73/74 (98%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>AAC51278.1 p40 [Homo sapiens]
          Length = 338

 Score =  150 bits (380), Expect = 2e-42
 Identities = 73/74 (98%), Positives = 73/74 (98%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>AAC51262.1 p40 [Homo sapiens]
          Length = 338

 Score =  150 bits (380), Expect = 2e-42
 Identities = 73/74 (98%), Positives = 73/74 (98%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>prf||1901303A Leu zipper protein p40
          Length = 338

 Score =  150 bits (380), Expect = 2e-42
 Identities = 73/74 (98%), Positives = 73/74 (98%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>AER41894.1 unknown [Homo sapiens]
          Length = 338

 Score =  150 bits (380), Expect = 2e-42
 Identities = 73/74 (98%), Positives = 73/74 (98%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>Q9UN81.1 RecName: Full=LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein;
           Short=L1ORF1p; AltName: Full=LINE retrotransposable
           element 1; AltName: Full=LINE1 retrotransposable element
           1 AAD39214.1 unknown [Homo sapiens]
          Length = 338

 Score =  150 bits (380), Expect = 2e-42
 Identities = 73/74 (98%), Positives = 73/74 (98%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>AAB60344.1 ORF1 [Homo sapiens]
          Length = 338

 Score =  150 bits (380), Expect = 2e-42
 Identities = 73/74 (98%), Positives = 73/74 (98%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>ABE73455.1 RNA-binding protein [Pan troglodytes]
          Length = 338

 Score =  149 bits (377), Expect = 6e-42
 Identities = 72/74 (97%), Positives = 73/74 (98%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNL+
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLD 74


>AAC51274.1 p40 [Homo sapiens]
          Length = 337

 Score =  149 bits (376), Expect = 8e-42
 Identities = 72/74 (97%), Positives = 72/74 (97%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQS SPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSTSPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>AAL50636.1 unknown [Homo sapiens]
          Length = 338

 Score =  149 bits (376), Expect = 8e-42
 Identities = 72/74 (97%), Positives = 72/74 (97%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQS SPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSTSPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>WP_077128851.1 hypothetical protein [Shigella sonnei]
          Length = 338

 Score =  148 bits (374), Expect = 2e-41
 Identities = 72/74 (97%), Positives = 72/74 (97%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSK QSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKKQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>CJS63992.1 L1 transposable element [Streptococcus pneumoniae] CNY15793.1 L1
           transposable element [Mycobacterium tuberculosis]
          Length = 338

 Score =  148 bits (374), Expect = 2e-41
 Identities = 72/74 (97%), Positives = 72/74 (97%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSK QSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKKQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


>AAC51266.1 p40 [Homo sapiens]
          Length = 338

 Score =  148 bits (373), Expect = 2e-41
 Identities = 72/74 (97%), Positives = 72/74 (97%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVEN EKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENVEKNLE 74


>AAC51277.1 p40 [Homo sapiens]
          Length = 338

 Score =  148 bits (373), Expect = 2e-41
 Identities = 72/74 (97%), Positives = 72/74 (97%)
 Frame = +1

Query: 124 MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWTENDFDELREEGFRRSNYSELREDIQ 303
           MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSW ENDFDELREEG RRSNYSELREDIQ
Sbjct: 1   MGKKQNRKTGNSKTQSASPPPKERSSSPATEQSWMENDFDELREEGVRRSNYSELREDIQ 60

Query: 304 TKGKEVENFEKNLE 345
           TKGKEVENFEKNLE
Sbjct: 61  TKGKEVENFEKNLE 74


Top