BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Coptis24_contig00003065
         (872 letters)

Database: ./nr 
           23,641,837 sequences; 8,123,359,852 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gb|AGE44289.1| beta-tubulin [Dimocarpus longan]                       590   e-166
gb|ABA46773.1| unknown [Solanum tuberosum]                            590   e-166
gb|ABA46752.1| unknown [Solanum tuberosum]                            590   e-166
sp|Q40106.1|TBB2_LUPAL RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltNa...   590   e-166
gb|AFN53689.1| putative tubulin beta-1 chain protein [Linum usit...   590   e-166

>gb|AGE44289.1| beta-tubulin [Dimocarpus longan]
          Length = 446

 Score =  590 bits (1522), Expect = e-166
 Identities = 290/290 (100%), Positives = 290/290 (100%)
 Frame = +1

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>gb|ABA46773.1| unknown [Solanum tuberosum]
          Length = 447

 Score =  590 bits (1522), Expect = e-166
 Identities = 290/290 (100%), Positives = 290/290 (100%)
 Frame = +1

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>gb|ABA46752.1| unknown [Solanum tuberosum]
          Length = 447

 Score =  590 bits (1522), Expect = e-166
 Identities = 290/290 (100%), Positives = 290/290 (100%)
 Frame = +1

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>sp|Q40106.1|TBB2_LUPAL RecName: Full=Tubulin beta-2 chain; AltName: Full=Beta-2-tubulin
            gi|1399450|gb|AAB03267.1| beta-tubulin 2 [Lupinus albus]
          Length = 448

 Score =  590 bits (1522), Expect = e-166
 Identities = 290/290 (100%), Positives = 290/290 (100%)
 Frame = +1

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Sbjct: 381  VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA 430


>gb|AFN53689.1| putative tubulin beta-1 chain protein [Linum usitatissimum]
          Length = 449

 Score =  590 bits (1522), Expect = e-166
 Identities = 290/290 (100%), Positives = 290/290 (100%)
 Frame = +1

Query: 1    GGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECM 180
            GGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECM
Sbjct: 141  GGTGSGMGTLLISKIREEYPDRMMLTFSVFPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENADECM 200

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Sbjct: 261  PRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGRYLTASAMFRGK 320

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            MSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRR
Sbjct: 321  MSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSTVCDIPPTGLKMASTFIGNSTSIQEMFRR 380

Query: 721  VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA 870
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Sbjct: 381  VSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATA 430