BLASTX nr result

ID: Cimicifuga21_contig00002541 seq

BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Cimicifuga21_contig00002541
         (633 letters)

Database: ./nr 
           23,641,837 sequences; 8,123,359,852 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gb|ABB16968.1| beta-tubulin-like protein [Solanum tuberosum]          428   e-118
ref|NP_001234807.1| beta-tubulin [Solanum lycopersicum] gi|77963...   428   e-118
gb|ACH68564.1| beta-tubulin [Solanum tuberosum]                       428   e-118
gb|ABP65322.1| beta tubulin [Capsicum annuum]                         428   e-118
gb|AAR37366.1| beta-tubulin [Nicotiana attenuata]                     428   e-118

>gb|ABB16968.1| beta-tubulin-like protein [Solanum tuberosum]
          Length = 451

 Score =  428 bits (1101), Expect = e-118
 Identities = 207/210 (98%), Positives = 209/210 (99%)
 Frame = -3

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           HQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKL+TPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSD
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           LRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYISLTVPELTQQMWD KNMMCAADPRHGR
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Query: 271 YLTASAMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLKMASTFVG 92
           YLTASAMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLKMASTFVG
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Query: 91  NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT 2
           NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT
Sbjct: 373 NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT 402


>ref|NP_001234807.1| beta-tubulin [Solanum lycopersicum] gi|77963735|gb|ABB13293.1|
           beta-tubulin [Solanum lycopersicum]
          Length = 451

 Score =  428 bits (1101), Expect = e-118
 Identities = 207/210 (98%), Positives = 209/210 (99%)
 Frame = -3

Query: 631 HQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLSTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSD 452
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           NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT
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>gb|ACH68564.1| beta-tubulin [Solanum tuberosum]
          Length = 451

 Score =  428 bits (1101), Expect = e-118
 Identities = 207/210 (98%), Positives = 209/210 (99%)
 Frame = -3

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           YLTASAMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLKMASTFVG
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Query: 91  NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT 2
           NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT
Sbjct: 373 NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT 402


>gb|ABP65322.1| beta tubulin [Capsicum annuum]
          Length = 450

 Score =  428 bits (1101), Expect = e-118
 Identities = 207/210 (98%), Positives = 209/210 (99%)
 Frame = -3

Query: 631 HQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLSTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSD 452
           HQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKL+TPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSD
Sbjct: 193 HQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSD 252

Query: 451 LRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYISLTVPELTQQMWDTKNMMCAADPRHGR 272
           LRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYISLTVPELTQQMWD KNMMCAADPRHGR
Sbjct: 253 LRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYISLTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGR 312

Query: 271 YLTASAMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLKMASTFVG 92
           YLTASAMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLKMASTFVG
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Query: 91  NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT 2
           NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT
Sbjct: 373 NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT 402


>gb|AAR37366.1| beta-tubulin [Nicotiana attenuata]
          Length = 450

 Score =  428 bits (1101), Expect = e-118
 Identities = 207/210 (98%), Positives = 209/210 (99%)
 Frame = -3

Query: 631 HQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLSTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSD 452
           HQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKL+TPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSD
Sbjct: 193 HQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSD 252

Query: 451 LRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYISLTVPELTQQMWDTKNMMCAADPRHGR 272
           LRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYISLTVPELTQQMWD KNMMCAADPRHGR
Sbjct: 253 LRKLAVNLIPFPRLHFFMVGFAPLTSRGSQQYISLTVPELTQQMWDAKNMMCAADPRHGR 312

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           YLTASAMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLKMASTFVG
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           NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT
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