BLASTX nr result
ID: Cimicifuga21_contig00002541
seq
BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011] Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402. Query= Cimicifuga21_contig00002541 (633 letters) Database: ./nr 23,641,837 sequences; 8,123,359,852 total letters Searching..................................................done Score E Sequences producing significant alignments: (bits) Value gb|ABB16968.1| beta-tubulin-like protein [Solanum tuberosum] 428 e-118 ref|NP_001234807.1| beta-tubulin [Solanum lycopersicum] gi|77963... 428 e-118 gb|ACH68564.1| beta-tubulin [Solanum tuberosum] 428 e-118 gb|ABP65322.1| beta tubulin [Capsicum annuum] 428 e-118 gb|AAR37366.1| beta-tubulin [Nicotiana attenuata] 428 e-118 >gb|ABB16968.1| beta-tubulin-like protein [Solanum tuberosum] Length = 451 Score = 428 bits (1101), Expect = e-118 Identities = 207/210 (98%), Positives = 209/210 (99%) Frame = -3 Query: 631 HQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLSTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSD 452 HQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKL+TPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSD Sbjct: 193 HQLVENADECMVLDNEALYDICFRTLKLTTPSFGDLNHLISATMSGVTCCLRFPGQLNSD 252 Query: 451 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271 YLTASAMFRGKMSTKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLKMASTFVG 92 YLTASAMFRGKMSTKEVDEQM+NVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLKMASTFVG Sbjct: 313 YLTASAMFRGKMSTKEVDEQMINVQNKNSSYFVEWIPNNVKSSVCDIPPTGLKMASTFVG 372 Query: 91 NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT 2 NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT Sbjct: 373 NSTSIQEMFRRVSEQFTAMFRRKAFLHWYT 402