BLASTX 2.2.25 [Feb-01-2011]


Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, 
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), 
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs",  Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.

Query= Cephaelis21_contig00020544
         (678 letters)

Database: ./nr 
           23,641,837 sequences; 8,123,359,852 total letters

Searching..................................................done



                                                                 Score    E
Sequences producing significant alignments:                      (bits) Value

gb|AAY29122.1| cement precursor protein 3B variant 3 [Phragmatop...    60   3e-07
gb|AAY29121.1| cement precursor protein 3B variant 2 [Phragmatop...    55   1e-05

>gb|AAY29122.1| cement precursor protein 3B variant 3 [Phragmatopoma californica]
          Length = 343

 Score = 60.5 bits (145), Expect = 3e-07
 Identities = 51/205 (24%), Positives = 96/205 (46%), Gaps = 1/205 (0%)
 Frame = -2

Query: 614 AQNQGGNYSSSSVIFPTSASGLNPSLEKQCTVNVSGNRGSRWGNRDELSWGKXXXXXXXX 435
           + +   +YSSSS  + +S+S  + S     + + S +  S + +    S           
Sbjct: 40  SSSSSSSYSSSSSSYSSSSSSYSGSSSSSSSYSSSSSSSSSYSSSSSSSSSSYSSSSSSY 99

Query: 434 XXSWENSATSRANTAWMPSGPISSASDGQQSYDRGQYQYIPSASSVGSWQNSTTSSASTA 255
                +S++S ++++   S   SS+S G  S       Y  S+SS  S+ +S++SS S++
Sbjct: 100 S---SSSSSSYSSSSSSSSSSYSSSSSGCSSSSSSSSSYSSSSSSSSSYSSSSSSSYSSS 156

Query: 254 WMLSQPISSASY-GQQSYDRGQYAPSASSVRSWQNIATNSAGTAWMLSRPISHASDG*QS 78
                  SS+SY    S     Y+ S+SS     + +++ + ++   S   S +S    S
Sbjct: 157 SSSYSSSSSSSYSSSSSSSSSSYSSSSSSYSGSSSSSSSYSSSSSSSSSYSSSSSSSSSS 216

Query: 77  YGRGQYVLSASSAGSWQNSATSSAS 3
           YG      S+SS+ S+ +S++SS+S
Sbjct: 217 YGSSSSSYSSSSSSSYSSSSSSSSS 241



 Score = 57.4 bits (137), Expect = 3e-06
 Identities = 55/219 (25%), Positives = 97/219 (44%)
 Frame = -2

Query: 659 NSKVQAGQSTALKIYAQNQGGNYSSSSVIFPTSASGLNPSLEKQCTVNVSGNRGSRWGNR 480
           +S   +  S++   Y+ +   +YSSSS  + +S+S    S     + + S +  S  G+ 
Sbjct: 131 SSSSYSSSSSSSSSYSSSSSSSYSSSSSSYSSSSSSSYSSSSSSSSSSYSSSSSSYSGSS 190

Query: 479 DELSWGKXXXXXXXXXXSWENSATSRANTAWMPSGPISSASDGQQSYDRGQYQYIPSASS 300
              S             S+ +S++S ++ +   S   SS      SY         S+SS
Sbjct: 191 SSSS-------------SYSSSSSSSSSYSSSSSSSSSSYGSSSSSYSSSSSSSYSSSSS 237

Query: 299 VGSWQNSTTSSASTAWMLSQPISSASYGQQSYDRGQYAPSASSVRSWQNIATNSAGTAWM 120
             S   S++SS+ ++   S   SS+S    SY     + S SS  S  +  ++S+ +++ 
Sbjct: 238 SSSSSYSSSSSSYSSSSSSSYSSSSSSSSSSYSSSSSSSSGSSYSSSSSSCSSSSSSSY- 296

Query: 119 LSRPISHASDG*QSYGRGQYVLSASSAGSWQNSATSSAS 3
            S   S +S    S     Y  S+SS+GS   S++SS+S
Sbjct: 297 -SSSSSSSSSSYSSSSSSSYSSSSSSSGSSSYSSSSSSS 334


>gb|AAY29121.1| cement precursor protein 3B variant 2 [Phragmatopoma californica]
          Length = 306

 Score = 55.5 bits (132), Expect = 1e-05
 Identities = 56/225 (24%), Positives = 101/225 (44%), Gaps = 4/225 (1%)
 Frame = -2

Query: 665 FDNSKVQAGQSTALKIYAQNQGGNYSSSSVIFPTSASGLNPSLEKQCTVNVSGNRGSRWG 486
           + +S      S++   Y+ +   +YSSSS    +S+S    S     +   S +  S + 
Sbjct: 74  YSSSSSSYSSSSSSSSYSSSSSSSYSSSS--SSSSSSSSYSSSSSSSSSYSSSSSSSSYS 131

Query: 485 NRDELSWGKXXXXXXXXXXSWENSATSRANTAWMPSGPISSASDGQQSYDRGQYQYIPSA 306
           +    S                +S++S ++ +   S   SS S    SY      Y  S+
Sbjct: 132 SSSSSSSSSY------------SSSSSSSSYSSSSSSSSSSYSSSSSSYSSSSSSYSSSS 179

Query: 305 SSVGSWQNSTTS----SASTAWMLSQPISSASYGQQSYDRGQYAPSASSVRSWQNIATNS 138
           SS  S+ +S++S    S+S++   S   SS+SY   S     Y+ S+SS  S+ + +++S
Sbjct: 180 SSSSSYSSSSSSSSSYSSSSSSSCSYSSSSSSYSSSSSSSSSYSSSSSSSSSYSSSSSSS 239

Query: 137 AGTAWMLSRPISHASDG*QSYGRGQYVLSASSAGSWQNSATSSAS 3
           + +    S   S +S    SY       S+SS+ S+ +S++SS+S
Sbjct: 240 SSSYSSSSSSYSSSSSS-SSYSSS----SSSSSSSYSSSSSSSSS 279